Phylonét Analyser les relations évolutives réticulées avec cette application.
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Phylonét Classement & Résumé

Phylonét Mots clés

Analyse transfert Analyser établir des relations processus évolutif Algorithme évolutif Créer un algorithme évolutif Développer un algorithme évolutif arbre évolutif Spécifiez l'algorithme évolutif évolutionniste Système de recherche évolutif Calcul évolutif clade évolutive Simulation évolutive transfert de gène Stocker le réseau phylogénétique simuler la génétique évolutive Méthode de trace évolutive Analyse de modèle évolutif Outil de biologie évolutive visionneuse de données évolutive Analyser les données évolutives relations WSDL des relations Logiciel Keyman AMHARIC aplikasi touche éditer www.nokia n72 logiciel.com wifi mot de passe biscuit PC mobile en Chine Téléchargement Gratuit Jeu lg gd350 pc www.soft Freez Driver Remover vista météo docklet enregistreur d'écran or Configuration antivirus gratuite

Phylonét La description

Phylonet est un outil pratique et facile à utiliser spécialement conçu pour offrir aux utilisateurs une suite d'outils permettant de reconstruire et d'analyser les relations évolutives réticulées (non tristes). En particulier, le progiciel comprend des fonctionnalités permettant de déduire un transfert de gènes horizontal d'une paire d'espèces / de gènes et de détecter des points d'arrêt de recombinaison interspécifiques dans un alignement de séquence. En outre, il a les capacités de lecture / stockage de réseaux phylogénétiques et de comparer les topologies des réseaux phylogénétiques. Comme les algorithmes de reconstruction et d'évaluation du réseau phylogénétiques utilisent des techniques algorithmiques du domaine des arbres phylogénétiques, l'emballage contient également plusieurs fonctionnalités orientées des arborescences, telles que des modules permettant de calculer les sous-armes de convention maximale, les mesures de distance de Robinson-Foulds, etc. Caractéristiques principales: Mât - Sous-arbre maximal d'accord RF - Robinson-Foulds / Différence symétrique Mesure d'arborescence RIATAHGT - Heuriste pour détecter les événements HGT d'une paire d'espèces / d'arbres de gènes LCA - ancêtre moins commun d'un ensemble de nuds dans un arbre Recompomp - une méthode basée sur une fenêtre pour détecter des points d'arrêt de recombinaison interspécifiques Charnet - Un outil de calcul des grappes, des arbres et des tripartitions dans un réseau CMPNets - Un outil de calcul de la distance entre deux réseaux NetPars - Un outil de notation du parcimonie des réseaux phylogénétiques CounteCoal - Un outil d'élimination de tous les scénarios de coalescents valides d'un gène dans les branches d'un arbre d'espèce Gencplex - Un outil permettant de générer une formulation MILP pouvant être résolue par CPLEX pour une espèce d'arbres et un ensemble de gènes Genst - un outil permettant de générer des topolodies d'arbres d'espèces basées sur des ensembles maximaux de grappes compatibles. Compute_ST (Cet outil est un script Perl) - pour reconstruire l'arbre d'espèce des arbres de gènes sous le coalecent. Infer_st - Pour inferrir l'arbre d'espèce à partir d'arbres géniques. Les méthodes contenues comprennent la MDC, le MDC avec le temps, le verre, le consensus de la majorité prolongée et le vote démocratique. Deep_Coal__Count - Pour compter le nombre de lignées supplémentaires versées par un ensemble de gènes arbres et d'arbres d'espèces SIM_GTINNETWORK - Pour simuler des arbres de gènes sous le modèle de réseau phylogénétique dans Yu et al. Papier SYST BIOL 2010

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