Outil magique Outil d'imagerie et de cluster de micro-carray
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Outil magique Classement & Résumé

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Outil magique La description

Magic Tool est une application Windows basée sur Java dont l'objet est de vous aider à analyser les fichiers TIFF à microparray DNA et à traiter les données d'hybridation comparative (chips de verre) et les informations affaissé. Sportable Runndyou peut tirer parti du fait que l'outil est livré dans un package portable. et le déploier directement sur votre ordinateur sans avoir à suivre un processus d'installation. De plus, votre registre Windows n'est pas gonflé avec des entrées inutiles. Vous pouvez le stocker sur n'importe quel lecteur flash USB ou d'autres appareils et vous le prendre. L'outil interfacémalique de l'utilisateur adopte une mise en page propre qui vous permet d'ajouter des fichiers dans l'environnement de travail à l'aide du bouton Parcourir intégré (il n'y a pas de support pour glisser-déposer). Vous pouvez prévisualiser le contenu du fichier, l'explorer à l'aide des fonctions de zoom avant et arrière, adaptez l'image à l'écran, définissez les points supérieurs gauche et droite, spécifier la ligne inférieure, ainsi que régler le nombre de lignes et de colonnes. Définition de nouveaux projetsLes application utilisent des projets de stockage de détails et de paramètres de configuration sur les données importées et les calculs effectués. Les projets peuvent être enregistrés et ajoutés pour des tâches d'édition futures. Vous pouvez importer des éléments avec différents formats de fichiers (TXT, JPEG, TIF, GIF, Grid, Info ou Flag), ajouter le contenu d'un dossier entier, insérer des fichiers dans le dossier de projet et mettre à jour le projet (les ajustements sont automatiquement appliqués), En plus de charger les paires d'images de tiff rouge et vert. De plus, vous pouvez charger la liste de gènes et créer une nouvelle grille ou ajouter un enregistré. En ce qui concerne la création de la grille, vous pouvez entrer le nombre total de grilles dans le fichier TIFF, spécifier l'orientation ponctuelle dans les grilles (horizontalement ou verticalement), ajuster le contraste pour éclairer des taches légères, la grille de courant central, entrez les informations de localisation de la grille. En utilisant trois clics (réglage des taches supérieure gauche et droite, ainsi que la rangée inférieure), ajustez la grille aux taches centrales, créez plusieurs grilles et signalez des taches problématiques (éventuellement). Distinguer le signal du bruit, générer une série de grappes et d'un outil meumagique vous permet de distinguer le signal de l'arrière-plan et de générer un fichier d'expression. Vous pouvez choisir entre différentes méthodes de distinction du signal d'arrière-plan, nommément cercle fixe ou adaptatif, option de croissance de la région ensemencée (conçue pour trouver le signal pour chaque point sur la base de la distribution du signal), ou des méthodes de rapport (premier plan au premier plan et en arrière-plan ou en arrière-plan. au premier plan et en arrière-plan afin de déterminer le rapport pour chaque fonctionnalité de la puce de la puce). De plus, vous pouvez répéter plusieurs étapes pour des conditions expérimentales dans votre étude, manipuler des données (transformer, normaliser, limiter les données, filtre ou brouiller), ajouter des informations sur les gènes au fichier d'expression, filtrer vos données en supprimant les gènes inutiles, calculez les dissemblables (en mesurant Les différences entre chaque paire de motifs d'expression génique) génèrent une série de clusters, créant une liste de tâches à effectuer en séquence et comparer les conséquences de différents choix pour quantifier, comparer et regrouper le même jeu de données bruts. Bottom Lineall Dans tous, un outil Magic s'avère être un outil fiable pouvant être utilisé comme un puissant instrument éducatif pour aider les élèves à explorer et à traiter des fichiers TIFF d'ADN Microarray. Avis écrit par Ana Marculescu, dernière mise à jour le 20 octobre 2014

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