Organisateur de génome viral Navigateur de génome à utiliser via Java
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Organisateur de génome viral Classement & Résumé

Organisateur de génome viral Mots clés

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Organisateur de génome viral La description

Organisateur de génome viral ou VGO créé pour être un navigateur de génome basé sur Java facile à utiliser. Il peut être utilisé pour afficher des informations sur un génome, y compris ses gènes, ses orfs et ses codons de démarrage / arrêt. Il peut également être utilisé pour effectuer une recherche d'expression régulière, une recherche de motif floue et une recherche de MassList. Parce que VGO parle à notre base de données de séquences de génome (COV), il peut être utilisé pour comparer les génomes. Caractéristiques principales: Voir les gènes et les Orfs prédits dans une ou une série de génomes. Afficher les codons de démarrage et d'arrêt de la séquence Rechercher des séquences dans Genomes en utilisant des expressions régulières; E.g GGATCC ou TTTTT T en utilisant un modèle de recherche floue; par exemple. GGATCC permettant une inadéquation Pour les gènes avec la plus haute composition Utilisez une interface graphique pour sélectionner et extraire des régions d'un génome Affiche les orthologs dans un ensemble de génomes en utilisant l'interface graphique pour sélectionner un gène dans un autre génome Affiche un tracé de composition nucléotidique. Recherche du plus long oligonucléotide partagé entre une série de génomes non alignés Rechercher dans le génome traduit pour les allumettes à des peptides de spécification de masse affiche graphiquement des données d'autres programmes au-dessus de l'affichage du génome

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