NemoÉtudier l'historique des ensembles phénotypiques | |
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Nemo Classement & Résumé
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- Licence:
- GPL
- Nom de l'éditeur:
- Siddhartha Jonnalagadda
- Systèmes d'exploitation:
- Windows All
- Taille du fichier:
- 3.5 MB
Nemo Mots clés
- extracteur extrait Analyser carte simulation simuler simulateur statistiques réseau Statistiques de réseau mutation de la population population afficher la population population mondiale Estimation de la population Simulation de génétique mendélienne Analyser la génétique mendélienne analyse de la génétique mendélienne Génétique émulée Génétique de transmission Laboratoire de génétique Recherche de génétique la génétique Évolution de la génétique de la population Répartition de la population Algorithme de génétique Simulateur de génétique de la population Génétique de la population Simuler le goulot d'étranglement de la population Goulot détranglement démographique simulateur génétique des populations Simulateur de population Les dynamiques de population moniteur de population Population autotétraploïde Analyse de la génétique de transmission simuler la génétique de transmission mélange de population estimer les paramètres de la population Taille efficace de la population Structure génétique de la population simuler la génétique évolutive simuler la population simulation de population population démographique population génétique Définir des groupes de population groupe de population population haploïde stratification de la population analyser la population Analyse de la population Simulation génétique de la population
Nemo La description
NEMO est un logiciel de simulation individuel, basé sur des particuliers, génétiquement explicite et stochastique, spécialement conçu pour étudier l'évolution de l'histoire de la vie / des traits phénotypiques et de la génétique de la population dans un cadre de population flexible (méta-). NemO met en uvre de nombreux événements de cycle de vie et de traits évolutifs avec une variété d'architectures génétiques. L'interaction des espèces entre un parasite et son hôte peut également être modélisée (c'est-à-dire une incompatibilité cytoplasmique induisant endosymbiont: wolbachia). Tout cela est encadré dans un modèle de métapopulation flexible qui permet des capacités de transport, des taux de dispersion, des taux d'extinction stochastiques / des taux de récolte et de la stochasticité démographique. Les populations peuvent être modifiées de manière dynamique lors d'une simulation, permettant aux goulets d'étranglement de la population, à la fusion de patch / fisson, à une expansion de la population, etc. La sélection hétérogène spatiale sur des traits quantitatifs peut également être modélisée. Caractéristiques principales: TRAITS : marqueurs neutres (microsatellites, SNPS) mutations délétères (avec des effets fixes ou aléatoires spécifiques à la locus, et la domination) TRAITS QUANTITATIFS (NOUVEAU EN V2.2.0) (avec LOCI QUANTITATIVE PLEIOTROPIC) dispersion (expression spécifique aux hommes et aux femmes) Wolbachia (Incompatibilité cytoplasmique à hérité maternelle inhumante endosymbiont) Cycle de vie Événements: élevage (avec la promiscuité, la polygymie, la monogamie, l'auto-accouplement et les systèmes d'accouplement de clonage) Disperse (modèle de piscine / propagule de piscine migrante, modèles de réseau 1D et 2D, etc.) vieillissement (avec régulation de patch de plafond) Sélection de la viabilité (basée sur des mutations délétères ou une sélection stabilisatrice sur des traits quantitatifs) extinction / récolte patch Fusion / Fission Crossing Design (SIB / Demi-SIB)
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