Mrbayes

Un outil pour vous aider avec votre estimation bayésienne de phylogénie.
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Mrbayes Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • GPL
  • Nom de l'éditeur:
  • Sebastian Hoehna
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 494 KB

Mrbayes Mots clés


Mrbayes La description

Mrbayes est une application simple et facile à utiliser spécialement conçue pour l'estimation bayésienne de la phylogénie. Le programme prend comme entrée une matrice de caractères dans un format de fichier Nexus. La sortie est plusieurs fichiers avec les paramètres échantillonnés par l'algorithme MCMC. Les MRBAYES peuvent résumer les informations contenues dans ces fichiers pour l'utilisateur. Caractéristiques principales: une interface de ligne de commande commune pour les systèmes d'exploitation Macintosh, Windows et Unix; Aide étendue disponible via la ligne de commande; Possibilité d'analyser le nucléotide, l'acide aminé, le site de restriction et les données morphologiques; mélange de types de données, tels que des caractères moléculaires et morphologiques, en une seule analyse; une méthode générale d'attribution de paramètres entre les partitions de données; une abondance de modèles évolutifs, dont 4 x 4, doublet et des modèles de codon pour les données de nucléotide et de nombreuses matrices de tarif standard pour les données d'acides aminés; estimation de sites positivement.selected dans un cadre de baies entièrement hiérarchique.


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