MLTREE est une petite application facile à utiliser conçue pour mettre en uvre une estimation maximale de vraisemblance de paramètres de modèle donnée une topologie fixe avec des longueurs de branche définies par l'utilisateur. Il comprend un modèle d'ADN de substitution ainsi qu'une série de modèles Markov conçus pour des caractères de 2 états.
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