Mauve MAUVE - Alignement de la séquence de génome multiple. Comparaison de séquence de génome
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Mauve Classement & Résumé

Mauve Mots clés

séquence Génome Comparaison de séquence de génome

Mauve La description

Mauve est un système permettant de construire efficacement plusieurs alignements de génome en présence d'événements évolutifs à grande échelle telles que le réarrangement et l'inversion. Plusieurs alignements de génome peuvent servir de base à la recherche sur la génomique comparative et à l'étude de la dynamique évolutive sur une nouvelle échelle. Aligner des génomes entiers est un problème fondamentalement différent d'aligner les séquences courtes. Mauve a été développé avec l'idée qu'un aligneur de génome multiple ne doit nécessiter que des ressources de calcul modestes. Il utilise des techniques algorithmiques qui vont bien dans la quantité de séquence alignée. Par exemple, une paire de génomes de Y. pestis peut être aligné en moins d'une minute, tandis qu'un groupe de 9 génomes enterrobactériens divergents peut être aligné dans quelques heures.

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