Mappiste

Un programme d'analyse des liaisons génétiques
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Mappiste Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • Freeware
  • Nom de l'éditeur:
  • Russell L. Malmberg
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 472 KB

Mappiste Mots clés


Mappiste La description

MapMaker est un ensemble d'applications pouvant être utilisées pour construire des cartes de liaison génétique et effectuer la cartographie des gènes. Livré à l'intérieur d'un emballage léger, il regroupe deux outils de ligne de commande, nommément mapmaker / Exp et MapMaker / QTL. Le premier est livré avec des options permettant de générer les groupes de liaison principale et d'analyser la sortie pour déterminer les marqueurs dominants, co-dominants et récessifs, alors que ce dernier vous aide à mapper des gènes en utilisant les cartes de liaison générées précédemment. MapMaker / Exp fonctionne avec des fichiers texte ASCII plats contenant le jeu de données dérivé de divers types de croix (backcross, intercross, testcross, données haploïdes). L'autre application fonctionne uniquement avec les données F2 Intercross et Backcross. Vous commencez par préparer le jeu de données pour l'analyse et le charger dans MapMaker / Exp. L'application est livrée avec une large gamme de commandes que vous pouvez utiliser pour répertorier, éditer, nommer ou effacer les séquences génétiques, insérer des marqueurs dans une séquence. Vous pouvez l'utiliser pour effectuer une analyse par paires pour paires de marqueurs et effectuer une analyse multi-points. Il peut affecter des marqueurs à un chromosome et afficher le statut de cartographie de certains locus. Le programme comporte des fonctionnalités de détection des erreurs de génotypage et vous permet de joindre aux haplotypes dans un ensemble de données unique. Il peut enregistrer les données à une base de données et enregistrer l'état et les résultats de mappage sur votre ordinateur. MapMaker / QTL est utilisé pour la mappage de gènes, mettant en vedette diverses commandes de trait et vous permettant de sauvegarder les données obtenues dans PostScript, comparez les cartes QTL et ainsi de suite.


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