Mac5 Un programme de reconstruction phylogénétique à l'aide de données gappées.
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Mac5 Classement & Résumé

Mac5 Mots clés

Estimation estimation Reconstruction de fichiers Packet Reconstruction Reconstruction de duplex Reconstitution 2D Reconstruction de surface Reconstruction estimer l'arbre phylogénétique Échantillonnage MCMC Alignement de l'ADN arbre phylogénétique Analyser les données phylogénétiques Données phylogénétiques construire des supertrees phylogénétiques créer des supertrees phylogénétiques reconstruction de phylogénie Relation phylogénétique Reconstruction de la cophylogène Algorithme de reconstruction reconstruction phylogénétique table de reconstruction Visionneuse de reconstruction reconstruction de feuille de calcul

Mac5 La description

L'application MAC5 a été conçue pour être un programme qui implémente un échantillonnage MCMC pour estimer un arbre phylogénétique d'un alignement multiple ADN. Ce qui différencie Mac5 à partir de programmes similaires est son utilisation de modèles d'évolution de la séquence de cinq états comme moyen d'inclure les informations d'écart lors de l'estimation d'un alignement. Malgré la vilification de ces modèles dans la littérature dans le passé, nous avons constaté que, dans de nombreuses circonstances, elles sont utiles pour améliorer la précision de l'estimation de la topologie.

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