MDL Dynamique moléculaire Langue
Télécharger maintenant

MDL Classement & Résumé

MDL Mots clés

simulation Langue Simulation de la dynamique moléculaire Dynamique moléculaire

MDL La description

Permet aux utilisateurs de représenter des simulations de dynamique moléculaire (MD) à un niveau élevé La langue de la dynamique moléculaire (MDL) est destinée à permettre aux utilisateurs de représenter des simulations de dynamique moléculaire (MD) à un niveau élevé. Cela inclut la possibilité d'interagir directement avec des simulations en cours d'exécution et de prototyper de nouveaux schémas d'intégration à l'aide de plusieurs méthodes différentes, y compris à la fois des objets et des fonctions qui mettent à jour les ensembles de position et de vélocité. La langue s'appuie sur Python et utilise un ensemble de bibliothèques enveloppées de scanne du Framework Software Protomol, développée en partie pour répondre aux fortes exigences de performance des calculs de la force à longue distance. Ajout et test des nouveaux algorithmes d'évaluation de la force sont aidés à la conception modulaire de MDL, ainsi que de nouveaux protocoles de simulation. L'API inclut la fonctionnalité permettant d'accéder aux données de simulation, aux données d'entrée et de sortie dans différents fichiers et formats, ajoutez des parcelles de données, ajoutez différents types de forces à des intégrateurs individuels, utilisez des intégrateurs existants à partir de la structure Protomol en Python et convertissent des vecteurs de données en matrices numériques rapides. .

MDL Logiciels associés