LA BÊTE Analyse des séquences moléculaires avec ce logiciel.
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LA BÊTE Classement & Résumé

LA BÊTE Mots clés

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LA BÊTE La description

Analyse évolutive bayésienne des arbres d'échantillonnage ou, simplement mettre, Beast, est une application conçue pour analyser les séquences moléculaires. Une description plus scientifique de son objectif serait de fournir les moyens de reconstruire les phylogénies et de fonctionner comme une plate-forme pour les tests d'hypothèse de l'évolution sans conditionnement sur une seule topologie des arbres. Il est basé sur Java, une dépendance qui n'est pas automatiquement téléchargée lors de la procédure d'installation du programme. Si Java n'est pas présent sur le système, le produit ne se lance pas.Fonctionnalité et utilisabilité du démarrage, Beast nécessite des paramètres initiaux, qui incluent la fourniture d'un fichier d'échantillon, définissant le nombre de chaînes et le choix entre les paramètres de Delta ou de température. L'analyse de la boîte peut prendre assez longtemps, surtout si un ordinateur spécifique plus bas est utilisé. Au cours de l'opération, les ressources système ne sont pas épargnées car elles sont soumises à des contraintes notables, à la fois de l'alimentation de la CPU et de l'utilisation de la RAM. En raison du format XML accepté par l'application, il n'est pas nécessaire de déterminer le type de chercheurs d'analyse souhaitant effectuer mais offre la possibilité de le sélectionner. Selon la documentation, il existe un inconvénient à cette approche car les modèles de construction peuvent ne pas bien performer dans le cadre d'inférence de la chaîne de la chaîne de Markov (MCMC). Aussi à la baisse, les données doivent être inspectées avec soin, car après avoir analysé sa bête ne propose pas une réponse simple. En tant que tel, certains bricoleurs sont nécessaires pour s'assurer que les informations ont été traitées correctement. ConclusionBeast est conçu comme un outil scientifique et ne répond pas à l'utilisateur moyen. Travailler avec ce n'est pas difficile, mais interprète les résultats et en veillant à ce que les données ont été traitées nécessitent correctement un fond solide dans l'analyse de la séquence moléculaire. Avis écrit par Ionut Ilascu, dernière mise à jour le 22 mars 2014

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