Jvirgel Un logiciel pour la simulation et l'analyse des données de protéomique
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Jvirgel Classement & Résumé

Jvirgel Mots clés

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Jvirgel La description

Jvirgel est une application puissante conçue pour déterminer les points isoélectriques théoriques (PI) et les poids moléculaires calculés (MW) des protéines. Il vous permet également de les visualiser comme une carte de protéines virtuelle bidimensionnelle (2D). L'utilisateur est capable de contrôler la présentation du gel 2D calculé de manière interactive en sélectionnant une plage PI / MW et une échelle de temps électrophorétique d'intérêt. Caractéristiques principales: importation de séquences d'acides aminés de FASTA, EMBL-File ou de la base de données proportionnelle via XML Prévision et visualisation des sécrétomes Prévision et visualisation des protéomes membranaires Traduction de l'indice d'adaptation de codon (CAI) dans la taille des points de protéines exclusion des protéines membranaires de la visualisation représentant des peptides signal et dans le clivage de silico qui entraîne une précision de prédiction supérieure de la PI et de MW Exportation de gels virtuels vers PNG- ou JPG-GRAPHICS Correspondance d'un gel expérimental avec un gel virtuel utilisant des algorithmes de régression différents Zoom sur une plage de pH / MW sélectionnable par l'utilisateur Les protéines peuvent être triées en groupes et toutes les données peuvent être exportées dans les tables CSV ou les tables de calcul MS-Excel Les protéines peuvent être colorées en fonction de leur contenu d'hélices transmembranaires ou de leur probabilité d'être sécrétées

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