Jtreeeview est un outil pratique et facile à utiliser conçu pour vous aider à voir les fichiers d'arbres. Cet objectif est limité au format de Newick (ou au format de sauvegarde personnalisé, sur la base de Newick). Les arbres peuvent être considérés comme étant enracinés ou non broquettés, redressés et tous les noms de nuds de nuds et de nuds peuvent être mis en évidence à l'aide de recherches d'expression régulières (point rouge dans l'arbre enraciné). Une caractéristique intéressante est la possibilité de charger un alignement de séquence contenant les séquences présentes dans l'arborescence. Cela permet à l'utilisateur de sélectionner un sous-arbre (branche) et d'examiner l'alignement des séquences présentes dans cette branche uniquement.
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