Ima

Afficher et analyser les informations génomiques à l'aide de cette application.
Télécharger maintenant

Ima Classement & Résumé

Publicité

  • Rating:
  • Licence:
  • GPL
  • Nom de l'éditeur:
  • Chris Shaw
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows NT / 2K / XP / Vista
  • Taille du fichier:
  • 26.8 MB

Ima Mots clés


Ima La description

Les IMA ou le système interactif d'analyse multigénomique sont un nouveau système d'analyse visuelle spécialement conçu pour la découverte des connaissances en informations génomiques. IMAS permet aux scientifiques génomiques d'analyser rapidement un ensemble de séquences génomiques microbiennes à l'aide d'outils tels que Glimmer, Blast, Clustalw, Primer3 et Transterm et pour visualiser la sortie de ces outils dans un cadre génomique unifié. Les IMA fournissent à l'utilisateur une interface graphique en zoom sur 1 dimension à une séquence génomique. L'utilisateur peut interagir avec la séquence à analyser pour la présence de régions de codage, qui peuvent être analysées davantage par une alignement de séquence avec des bases de données locales et distantes à l'aide d'une explosion. Les résultats de l'explosion sont affichés dans un cadre graphique unifié permettant à l'utilisateur de filtrer et de sélectionner des hits d'intérêt d'explosion. Les hits d'explosion sélectionnés peuvent ensuite être multiples à l'aide de Clusttalw, et ces multimalistes sont affichés à l'aide du cadre graphique commun. Les multisignements et les alignements par paires peuvent être annotés par l'utilisateur pour référence future et des rapports HTML peuvent être générés montrant ces résultats. Caractéristiques principales: Interface utilisateur zoomable - Fast! exécute des programmes d'analyse localement (Blast, Glimmer, Clustal ...) IMAS Blast peut rechercher la base de données NCBI NR exécute HMMPFAM sur une copie locale des données PFAM peut créer des dbs de souffle à partir de fichiers XML INSDSEQ


Ima Logiciels associés

Gausssum

Gausssum est une application d'interface graphique pouvant analyser la production d'ADF, Gamess, etc. ...

777 10.4 MB

Télécharger