Hapsim

Simulez les données d'association de contrôle de cas avec cet outil minuscule.
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Hapsim Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • Freeware
  • Nom de l'éditeur:
  • Bernard North
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 103 KB

Hapsim Mots clés


Hapsim La description

HAPSIM est une petite application d'invite de commande, conçue pour simuler des données d'association de cas-Contrôle dans lesquelles un locus de sensibilité aux maladies est potentiellement dans une liaison étroite avec un groupe de marqueurs bialléliques pouvant être étroitement liés les uns avec les autres. La procédure consiste en plusieurs étapes et génère un fichier de sortie contenant des échantillons de taille égale d'individus affectés et non affectés avec leurs génotypes. Le génotype sur le locus de sensibilité de la maladie elle-même n'est pas émis mais est utilisé pour générer le cas et contrôler les phénotypes basés sur un modèle de maladie spécifié par l'utilisateur. Le processus de simulation comprend cinq phases distinctes: la mutation pour produire des marqueurs; recombinaison entre les marqueurs; mutation pour produire une ou plusieurs allèles de maladie; recombinaison entre la maladie et les locations de marqueurs; Sélection de l'échantillon conditionnel sur un modèle de maladie.


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