Gs2 Analyser les études de l'association de génome avec cet outil.
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GS2 est une petite application simple spécialement conçue pour vous aider à analyser et à visualiser des études d'association de génome entier. Avec des progrès récents de l'efficacité de la technologie de génotypage de la nucléotide à haut débit (SNP), des études d'association génomique sont maintenant systématiquement entreprises avec les tailles d'échantillons nécessaires pour détecter les effets génétiques modestes que nous prévoyons des maladies complexes. Caractéristiques principales: Importation facile d'ensembles de données de données de génotypage à grande échelle. Les formats actuellement pris en charge sont des fichiers standard PED / DAT, le format de lit et les fichiers génotypes HAPMAP. Effectuer un contrôle de la qualité basé sur des seuils spécifiés par l'utilisateur. arrangez des ensembles de données dans la structure basée sur des projets en suivant la trace de la progression de votre analyse et créez des sous-ensembles distincts de vos données en fonction de la stratification, des seuils de contrôle de la qualité différents ou des caractéristiques biologiques et des fonctionnalités. Exporter des sous-ensembles de vos données dans différents formats de données à utiliser pour exécuter une analyse externe supplémentaire ou partager vos résultats et vos données. interpréter vos données dans un contexte pertinent en reliant une annotation biologique telle que la base de données génomique et les informations génomiques de l'UCSC Utilisez des ontologies Gene pour sélectionner des marqueurs en recherchant des mots-clés de la fonction d'annotation pour la fonction moléculaire, la localisation cellulaire et le processus biologique. Explorez les motifs de déséquilibre de liaison en utilisant des fonctions intégrées pour les calculs interactifs et les visualisations. Méthodes intégrées pour calculer les statistiques de base et effectuer des tests d'association. Économisez des projets entiers en format binaire. Les avantages comprennent l'enveloppement de plusieurs jeux de données dans un fichier compact qui prend plus d'espace sur le disque. Terrain de génotypage brut Intensités

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