Genemir

Recherche unifiée des prévisions ciblées de Mammalian Micarnan.
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Genemir Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • Freeware
  • Nom de l'éditeur:
  • Diva Tommei
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows XP / Vista / 7
  • Taille du fichier:
  • 21.4 MB

Genemir Mots clés


Genemir La description

L'application logicielle Genemir est un outil destiné aux biologistes et à des bioinformaticiens qui souhaitent trouver des modèles de prédiction et d'expression dans des ensembles de micrarnas et de gènes. Le programme fonctionne avec les données de prévision de la souris et de la cible humaine. L'un des deux types de requêtes peut être fait en sélectionnant: · Un ou plusieurs microarnas; · Un ou plusieurs gènes ou transcrits; Obtenir respectivement: · Une liste de gènes prévus pour être ciblé par les microarnas sélectionnés; · Une liste de microarnas prévu pour cibler les gènes sélectionnés ainsi qu'une liste complète de gènes ciblés par ces micrarns. Chacune de ces requêtes peut être modifiée par les filtres, qui permettent à l'utilisateur de sélectionner / désélectionner l'un des algorithmes de prédiction et de spécifier des critères de seuil qui déterminent l'ensemble de micrarnas ou de gènes renvoyés. Les niveaux d'expression de chaque élément dans l'ensemble de sortie ainsi que l'expression moyenne de tous les gènes dans cet ensemble peuvent être considérés comme un histogramme. Les histogrammes affichent des niveaux d'expression sur différents tissus mesurés dans le jeu de données GNF Symatlas (voir la section Types de données), en moyenne les valeurs d'expression de chaque probeset représentant le même gène. Les données d'expression externes peuvent également être importées et visualisées de la même manière (voir la section de tendance de l'expression et la section de données de chargement). Chaque élément de l'ensemble de résultats peut être lié aux ressources Web externes. Toute liste de gènes conformes au format décrit dans la section Format de fichier de conversion peut être traitée par la fonction d'identifiants de convertis en un des quatre identificateurs de gène différents: Réfsq, symbole Gene, GNF / Affymetrix et Ensembl. Donnez à Genemir un essai de voir ce que c'est vraiment capable de!


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