FragmentationAnalyzer

Un outil Java autonome pour analyser les données de fragmentation MS / MS
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FragmentationAnalyzer Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • Apache License 2.0
  • Nom de l'éditeur:
  • Harald Barsnes, Lennart Martens
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 12.2 MB

FragmentationAnalyzer Mots clés


FragmentationAnalyzer La description

L'analyseur de fragmentation est un instrument open source basé sur Java pouvant être utilisé pour analyser les données de fragmentation MS / MS. Neuf types d'analyse différents sont pris en charge: · Visualisation des spectres - Visualisez les spectres MS / MS avec une annotation d'ions de fragment, du zoom et de la séquençage manuel de la séquençage. · Terrains de boîte d'intensité - Analyser la variation d'intensité pour un ensemble d'identification du même peptide. · Corrélation d'intensité - Détectez la manière dont l'intensité est corrélée à l'intensité de la propagation. · Méta-parcelles d'intensité - analyser en outre les variations d'intensité. · Terraçages de dispersion des erreurs de masse - Visualisez l'erreur de masse diffusée dans un ensemble d'identifications / spectres sélectionnées. · Des parcelles de bulle d'erreur de masse - même que les parcelles de dispersion des erreurs de masse mais avec des intensités de pointe ajoutées. · Groupe d'erreur d'erreur de masse - Analyser la variation des erreurs de masse. · Tracé de probabilité d'ion fragment - Analyser la probabilité d'observer des ions de fragment spécifiques. · FRAGMENT ION HEAT MAP - Comparez la fragmentation à l'aide de cartes de chaleur des données de corrélation. Caractéristiques principales: prend en charge trois formats d'entrée: MS_LIMS 7 Mascot dat Fichiers Fichiers OMSSA OMX


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