Faste une application de comparaison de protéines ou de nucléotides rapides
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Faste Classement & Résumé

Faste Mots clés

Comparaison accès Courir protéine vite-fait Run rapide Programmes d'accès Mon accès de documents nucléotide touches chaudes Accès de documents

Faste La description

FASTA est une suite d'applications complète qui peut être utilisée pour une comparaison rapide de protéines ou de nucléotides. Ce programme atteint un niveau élevé de sensibilité à la recherche de similarité à grande vitesse. Ceci est réalisé en effectuant des recherches optimisées pour des alignements locaux à l'aide d'une matrice de substitution. La vitesse élevée de ce programme est réalisée en utilisant le modèle observé des hits de mots pour identifier des correspondances potentielles avant de tenter plus de recherches optimisées de temps en temps. Le compromis entre la vitesse et la sensibilité est contrôlé par le paramètre KTUP, qui spécifie la taille du mot. L'augmentation du KTUP diminue le nombre d'hits de fond. Tous les mots touchés ne sont pas étudiés, mais recherchent à la place initialement des segments contenant plusieurs hits à proximité.

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