Familier Analyser les séquences d'ADN avec cet outil.
Télécharger maintenant

Familier Classement & Résumé

Familier Mots clés

analyseur Analyse Analyser outil d'ADN Analyser l'ADN Économiseur d'écran ADN Visualisation de l'ADN ADN Analyser Analyser l'ensemble de données ADN gérer l'ADN analyser l'ADN matrice micro Analyser les données de l'ADN Analyser les séquences biologiques Modifier les séquences d'ADN Éditeur de séquences d'ADN Analyse de coordonnées principale Analyse de séquences d'ADN Analyser les séquences d'ADN Analyser l'alignement de l'ADN Séquences d'ADN alignées Séquences d'ADN Analyser les séquences moléculaires analyser l'ADN mitochondrial Analyser les données de méthylation de l'ADN Analyser les séquences de polypeptide analyser les séquences métagénomiques Analyse des séquences d'ARN Analyser les séquences d'ARN Analyser la restriction de l'ADN séquences

Familier La description

L'empreinte digitale à l'ADN (AFLP, RAPD, ISSRS, etc.) apportera intrinsèquement des incertitudes avec eux, que ce soit un bruit associé à la technique, ou des erreurs effectuées dans la notation, etc. Vous pouvez marquer vos données à l'aide de l'absence / de la présence (0/1). Cela signifie que vous tenterez de partitionner des points de données sur lesquels vous n'êtes pas sûr des absences et des présences (pour être conservatrice, probablement des absences plutôt que des présences). Alternativement, vous pouvez permettre aux incertitudes: (0 /? / 1). Cela vous permet d'avoir plus tard un deuxième regard sur vos données et de demander quel impact sur ces données ambiguës ou manquantes pourraient avoir sur votre analyse. Famd est une petite application facile à utiliser spécialement conçue pour vous aider à le faire. Traiter spécifiquement les données manquantes (ou ambiguës), FAMD implémente les éléments suivants: · Minimum / maximum / moyen (DIS) Calcul de la similarité permettant l'estimation de la mesure dans laquelle les données manquantes peuvent avoir une incidence sur l'analyse. · Les similitudes de Jaccard, les dés, les distances de Néili et euclidiennes · Sortie des matrices de distance · Rééchantillonnage des données manquantes · Estimation de l'indice de Shannon par bootstrapping. · UPGMA, NJ, strict et majoritaire Consensus Arbres · Estimation du soutien R · PCOA (analyse de coordonnées principale) et spectateur 3D avec bitmap et support de métafichier · Amova pour toutes les mesures de similarité mises en uvre (DIS) · Exporter des données sur un certain nombre de formats tels que Nexus, Arlequin Project, Hindex, Hickory (Block Nexus Alleles), GenePop, Ntsyspc, Structure, Hindex. · Estimation bayésienne de la fréquence d'allèle nulle de population et de calcul des distances inter-population.

Familier Logiciels associés