Erminej

Analyser des gènes avec cette application.
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Erminej Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • Freeware
  • Nom de l'éditeur:
  • Paul Pavlidis
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 13.7 MB

Erminej Mots clés


Erminej La description

ErmineJ est un outil pratique et facile à utiliser conçu pour vous aider à effectuer une analyse des ensembles de gènes dans l'expression de données micro-matrices ou d'autres données à l'échelle du génome entraînant des classements de gènes. Un objectif typique est de déterminer si des voies biologiques particulières sont «faisant quelque chose d'intéressant» dans les données. Le logiciel est conçu pour être utilisé par les biologistes avec peu ou pas d'information sur l'informatique. Caractéristiques principales: Mise en uvre de plusieurs méthodes d'analyse des gènes: Analyse sur la surprésentation une méthode basée sur un rénovation utilisant des scores de gènes une méthode basée sur le rang qui utilise des scores de gènes une méthode à résamplage utilisant une corrélation entre les profils d'expression génique (un type d'analyse "enrichissement de grappes"). Gene Ensems reçoive des scores statistiques (valeurs P) et une correction de plusieurs tests est prise en charge. Soutien de la terminologie de l'ontologie des gènes; Les utilisateurs peuvent choisir les aspects à analyser. Les fichiers utilisateur utilisent des formats de texte simples. Les utilisateurs peuvent modifier des ensembles de gènes ou créer de nouveaux. Les résultats peuvent être visualisés dans le logiciel. Il est simple de comparer plusieurs analyses des mêmes données définies avec différents paramètres. Les hyperliens définissables par l'utilisateur sont fournis sur des sites externes pour permettre une navigation plus efficace des résultats. Pour les programmeurs, il existe une interface de ligne de commande ainsi qu'une simple interface de programmation d'applications pouvant être utilisée pour brancher la fonctionnalité Erminej dans votre propre code


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