Empilement

Un plugin pour la plate-forme d'analyse d'image Imagej
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Empilement Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • GPL
  • Nom de l'éditeur:
  • Babraham Bioinformatics
  • Taille du fichier:
  • 92 KB

Empilement Mots clés


Empilement La description

StackMeasure est un plug-in graphique conçu pour vous permettre d'identifier les caractéristiques d'intérêt et de vous permettre de mesurer la distance entre elles. Les caractéristiques intéressantes sont des groupes de voxels à regroupement spatiale avec la même couleur (ou similaire). StackMeasure peut fonctionner avec un seul fichier image RVB, avec des fichiers TIFF noir et blanc séparés (un pour chaque canal) ou avec des fichiers ZEISS LSM. Avec les fichiers RVB, vous pouvez définir la quantité de flexibilité que vous souhaitez autoriser en correspondance de couleur, mais avec les autres formats, les canaux sont complètement séparés. StackMeaisil avec ensuite identifier un ensemble de fonctionnalités et vous donner des détails sur leur position et leur volume. Il générera une pile d'images composite et peut rendre une version 3D de votre pile afin de mieux visualiser les fonctionnalités. Une fois que vous avez défini vos fonctionnalités, vous pouvez mesurer les distances entre elles. Vous pouvez le faire de leur centre de masse ou de leur limite la plus proche. Vous pouvez également choisir de fusionner toutes les fonctionnalités dans un canal et de trouver la distance la plus proche entre 2 canaux.


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