Copasi analyse des réseaux biochimiques et simulation facilitée.
Télécharger maintenant

Copasi Classement & Résumé

Copasi Mots clés

Analyse Analyser Analyse des réseaux de signalisation Station de système biochimique biochimique cinétique biochimique Simulateur biochimique Analyse des réseaux de contact équation biochimique simuler des réseaux biochimiques Analyse des réseaux biochimiques Réseaux biochimiques

Copasi La description

COPASI est un outil fiable conçu pour vous aider à analyser les réseaux biochimiques et leur dynamique. Il propose une interface graphique facile à utiliser qui vous permet de configurer les réseaux, d'ajouter des tâches et de générer des rapports. Cet outil est un programme autonome qui prend en charge les modèles de la norme SBML et peut simuler leur comportement en utilisant des oDES ou des algorithmes de simulation stochastiques de Gillespie; Des événements discrets arbitraires peuvent être inclus dans de telles simulations. COPASI effectue plusieurs analyses du réseau et de sa dynamique et dispose d'un support important pour l'estimation et l'optimisation des paramètres. COPASI fournit des moyens de visualiser des données dans des parcelles personnalisables, des histogrammes et des animations de diagrammes de réseau. Caractéristiques principales: Modèle: Réaction chimique Réaction. Fonctions cinéaniques arbitraires. Odes pour des compartiments, des espèces et des quantités mondiales. missions pour les compartiments, les espèces et les quantités mondiales. missions initiales pour les compartiments, les espèces et les quantités mondiales. Import SBML (L1V1 + 2, L2V1-4) et Exporter (L1V2, L2V1-4). Analyse : Simulation de cours de temps stochastique et déterministe analyse d'état stable (y compris la stabilité). Analyse de contrôle métabolique / analyse de sensibilité. Analyse du mode élémentaire . analyse de la conservation de masse. Analyse de séparation de l'échelle de temps Calcul des exposants LYAPUNOV. Paramètre scanns. optimisation des fonctions objectives arbitraires. Estimation des paramètres à l'aide de données du cours de temps et / ou des expériences d'état stable simultanément. Interface utilisateur graphique (Copasiui) curseurs pour les changements de paramètres interactifs. Tables codées par couleur Tableaux à barres 3D parcelles et histogrammes. Visualisation des résultats du diagramme de réseau. ligne de commande (copase) pour le traitement par lots. versions pour MS Windows, Linux, Mac OS X et Solaris SPARC. Loading of Legacy Gepasi Files. Exporter vers Berkeley Madonna, Xppaut et C code source du système ODE généré par le modèle. Sauvegarde des formules mathématiques et des odeurs en mathml ou en latex

Copasi Logiciels associés