Compasses

Effectuer des recherches Motif à l'aide de cet outil.
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Compasses Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • GPL
  • Nom de l'éditeur:
  • Giuseppe Maccari
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows NT / 2K / XP / Vista / 7
  • Taille du fichier:
  • 1 MB

Compasses Mots clés


Compasses La description

Les compasses (modèle complexe du logiciel de recherche de séquence) est un outil simple et efficace qui permet aux génomes entiers miniers pour la présence d'éléments complexes. L'outil est convivial, flexible et sans ressource intensive et capable de parcourir des génomes entiers en quelques minutes. Les boussoles appliquent l'algorithme de jumelage de plusieurs motifs multiples Wu-Manber bien connu pour rechercher de manière exhaustive le motif de l'ensemble de la SE. Les éléments d'entrée peuvent être des séquences conservées simples (comme dans le moteur de blindage), des séquences partiellement ou très dégénérées, voire plusieurs séquences dégénérées, reliées par des entretoises de longueur variable mal conservées. Cette petite application fournira les types de recherche suivants: DAS, NCBI (base de données) ou lot.


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