Clustal xCette application présente un programme d'alignement de séquence multiple à usage général pour l'ADN ou les protéines. | |
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Clustal x Classement & Résumé
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- Licence:
- Freeware
- Nom de l'éditeur:
- The European Bioinformatics Institute
- Systèmes d'exploitation:
- Windows All
- Taille du fichier:
- 4.7 MB
Clustal x Mots clés
- profil séquence Visualisation des protéines Nombre de protéines de mammifère alignement alphabétique Analyser l'alignement de la séquence Analyseur d'alignement de séquence Voir l'alignement de la séquence Analyser la séquence d'ADN Alignement de la séquence multiple Éditeur de séquence d'ADN créer un alignement de séquence créateur d'alignement de séquence faire un alignement de séquence Données d'alignement de la séquence Comparez la séquence d'ADN Alignement de l'ADN Alignement du profil ADN correspondance des séquences alignement global de séquence Visionneuse d'alignement de séquence L'alignement des séquences Algorithme d'alignement de séquence Éditeur d'alignement multiple Alignement multiple Séquence d'ADN génomique Alignement de la séquence d'ADN Analyse d'alignement de la séquence Analyser l'alignement de l'ADN Alignement de la structure de séquence Analyser les protéines membranaires Analyse des protéines membranaires analyser plusieurs séquences .3vid .com iTranslator 2003 LG Optimus 2x Nokia gratuit 5800 Conducteur pour Philips Nokia Themes Installer Thèmes Pst Babe Editeur vidéo HT7.0 Skype Debian Multiarch pilote de webcam proseries JN0130 Test Mesinger downald yahoo
Clustal x La description
Clustal X est un programme avancé qui traite d'un alignement de séquences multiples pour les protéines et l'ADN. Conçu comme une intervention d'interface graphique pour Clustalw, le programme effectue une analyse de séquence approfondie, tout en offrant de nombreux utilitaires à effectuer des comparaisons appropriées.Load multiples formats spécialisés Le programme est capable de travailler avec des séquences prêts, importées à partir de fichiers des formats suivants: embl / Swissprot, NBRF / PIR, Pearson (FASTA), GCG / MSF (Pilep), Clustal (* .aln), GCG9 / RSF et GDE. Au cours du processus d'importation, Clustal X tente de détecter si les séquences sont des nucléotides ou des acides aminés, mais il n'y a pas de garantie réelle que le choix sera correct. Soulignez intelligemment des éléments importantsSonce Le fichier source a été chargé, l'alignement de la séquence sera affiché dans la fenêtre principale du programme. Le schéma de coloration intégré sert à mettre en évidence des caractéristiques conservées, ce qui les a déplacés par des couleurs vives. Afin de distinguer le contenu des séquences, il est recommandé d'utiliser une police plus grande; Cela entraînera une vue de séquence zoomée, ce qui facilitera la possibilité de repérer sa composition. Processus d'alignement facile Les opérations autorisées par le programme font toute la liste; Vous pouvez ajouter une séquence à un alignement existant, couper ou coller un fragment, ainsi que pour rechercher une chaîne ou pour éliminer les lacunes existantes. De plus, vous pouvez effectuer des alignements via l'une des méthodes suivantes: complète (la séquence subira une analyse complète), guider uniquement l'arborescence ou un réalignement des séquences sélectionnées et / ou des chaînes de résidus. Il est recommandé d'atteindre avant de commencer un processus d'alignement, vous réinitialisez tous les paramètres (de nouvelles lacunes, des lacunes protéiques) afin que les résultats soient concluants. Analyser les données et obtenir un indice de qualité d'alignement de l'indicatif le plus important de l'analyse sera le score de qualité d'alignement, qui est tracé pour chaque colonne individuellement. Un score élevé désigne une colonne bien conservée, tandis que de faibles niveaux de conservation sont indiqués par un score inférieur. En conclusion, l'analyse dépend d'une variété de paramètres, qui devrait être définie conformément à l'objectif scientifique qui doit être effectué. Très certainement, le programme fait un excellent choix pour les scientifiques, ainsi que les étudiants qui cherchent à établir un transporteur en séquençage de l'ADN. Avis écrit par Andreea Matei, dernière mise à jour le 21 juillet 2014
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