Cbcanalyzer inferner des phylogénies basées sur des modifications de base compensatoires (CBCS)
Télécharger maintenant

Cbcanalyzer Classement & Résumé

Cbcanalyzer Mots clés

simuler des phylogénies simulation de phylogénie Estimer les grandes phylogénies Grande estimation de phylogénies Analyse de grande phylogénie Changement de base compensatoire CT Transformer CBC Détecter Cttransform Cbcdetect Arbre CBCT

Cbcanalyzer La description

Le CBCanalyzer (CBC = changement de base compensatoire) a été développé pour être une boîte à outils logicielle écrite personnalisée composée de trois parties, CTTransform, CBCDETect et CBCtree. CTTRANSFORD lit plusieurs formats de fichier CT (CT, RNAVIZ CT ou MAC CT) et génère un format dûment appelé `` Backet-Dot-Support-Backet '' 'est généralement utilisé comme entrée pour d'autres outils tels que RNAforerester, Rnamovie ou Marna. Ce dernier crée un alignement multiple basé sur des séquences primaires et des structures secondaires qui peuvent désormais être utilisées comme entrée pour CBCDetect. En voici, nous comptons pour CBCS dans toutes les séquences alignées, ce qui est important dans la détection des espèces, discriminant leur incompatibilité sexuelle. La matrice de comptage (distance) obtenue par CBCDetect est utilisée comme entrée pour CBCtree qui reconstruit un phylogramme en utilisant l'algorithme de Bionj.Note: CBcanalyzer est disponible gratuitement pour une utilisation non commerciale.

Cbcanalyzer Logiciels associés