Caryoscope

Visualisation des données d'expression dans un contexte de génome entier.
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Caryoscope Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Nom de l'éditeur:
  • Ihab A.B. Awad
  • Systèmes d'exploitation:
  • Windows All
  • Taille du fichier:
  • 7 MB

Caryoscope Mots clés


Caryoscope La description

Caryoscope est un composant UI Java réutilisable et un ensemble d'utilitaires d'analyse, d'outils de ligne de commande et d'une interface graphique d'application pour visualiser des données d'expression de gène dans un contexte de génome entier. Caryoscope est un package logiciel qui vous permet d'afficher et d'explorer des données numériques en fonction de la position génomique. Par exemple, Caryoscope a été utilisé pour "dessiner" des données de micropomédie sur un ensemble de chromosomes afin que les modifications du numéro de copie de l'ADN puisse identifier les régions de perte de chromosome ou de duplication dans le génome des cellules tumorales (NAT Genet. 1999 SEP; 23 (1) : 41-6). De plus, les niveaux d'expression d'ARNm mesurant des données de micropuce peuvent également être visualisés dans un contexte génomique utilisant Caryoscope (PNAS 2002 Dec 10; 99 (25): 16144-9). Les données visualisées avec Caryscope n'ont pas besoin de ne pas être limitées aux données de microréservie - Toute type de données numériques pouvant être représentées en fonction de la position génomique peut être visualisée à l'aide de Caryoscope. Obtenez Caryoscope et essayez de voir ce que c'est tout!


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