CLANS Un petit outil écrit en Java pour analyse de cluster de séquences.
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CLANS Classement & Résumé

CLANS Mots clés

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CLANS La description

Fréquemment, l'homologie est utilisée comme une raison de transférer des connaissances sur la fonction ou la structure de la part de protéines inconnues. Bien que les phylogénies soient la méthode de choix lorsque vous essayez de déterminer l'homologie, le marqueur le plus fréquemment utilisé est une similitude de séquence par paires. Le problème de la recherche de groupes de gènes co-réglementés à travers un certain nombre d'expériences de micropuce est assez similaire au problème de la recherche de groupes de protéines homologues dans un vaste ensemble de données. Dans les deux cas, nous avons d'énormes quantités de données et recherchons ces rares gènes qui montrent une sorte de similarité significative. La co-régulation putative ainsi que la homologie putative sont généralement déduites de similitudes dans l'ensemble des caractéristiques d'un gène. Dans le premier cas, le jeu de caractéristiques est constitué des niveaux d'expression dans les expériences, dans le second cas des séquences d'acides aminés des protéines. Une certaine similitude est également apparente lorsque vous examinez les graphiques générés par des données de séquence de protéines ou des données de micropuce. Obtenez des clans et prenez-le pour un tour pour voir ce qu'il peut faire pour vous!

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