Bowtie pour Linux Bowtie pour Linux est un aligneur de lecture courte ultra-efficace, efficace de la mémoire.
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Bowtie pour Linux Classement & Résumé

Bowtie pour Linux Mots clés

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Bowtie pour Linux La description

Publicité Bowtie for Linux est un logiciel de maison et d'éducation développé par Ben Langmead. Après notre essai et notre test, le logiciel est prouvé officiel, sécurisé et gratuit. Voici la description officielle de Bowtie pour Linux: Modifier par Bowtie pour Linux est un aligneur de lecture court-efficace ultra-efficace. Il alignit les séquences d'ADN courtes (lit) au génome humain à une vitesse de 25 millions de lectures par heure sur une station de travail typique avec 2 gigaoctets de mémoire. Bowtie indexe le génome avec un index de Burrows-Wheeler pour garder son empreinte de mémoire petit: 1,3 Go pour le génome humain. Il prend en charge les politiques d'alignement équivalentes à la maq et au savon, mais c'est beaucoup plus rapide: environ 35 fois plus rapide que le maq et plus de 350 fois plus rapidement que le savon lors de l'alignement du génome humain. Caractéristiques: Correction de tous les problèmes connus avec les options --Unfa / - Infre: Ils fonctionnent maintenant correctement avec plusieurs threads. Problème fixe où séquence et quarts ont parfois été inversés. Correction d'autres problèmes provoquant une omission parasite des lectures non alignées. Ajouté --MAXFA / - Maxfq Options de manière à lire qui ne s'allonge pas en raison de la limite -M peut être larguée séparément des lectures qui ne s'alignent pas du tout. La sortie d'alignement est maintenant garantie d'être "déterministe" même lorsque plusieurs threads sont utilisés. C'est-à-dire que, étant donné que la même entrée se lit (dans n'importe quel ordre) et le même --Ed, Bowtie produira les mêmes alignements chaque fois qu'il est exécuté, mais pas nécessairement dans le même ordre. Cela ne tient pas dans différentes versions de Bowtie. Plusieurs autres corrections de bugs.

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