Bissnp BISULFITE-SEQ / NOME-SEQ SNPS et Cytosine Methylation Appeler
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Bissnp Classement & Résumé

Bissnp Mots clés

SNP

Bissnp La description

BissnP a été spécialement développé comme outil utile basé sur la boîte à outils d'analyse du génome. BissnP utilise l'inférence bayésienne avec des probabilités de méthylation spécifiées manuellement ou spécifiées manuellement ou automatiquement de contexte de cytosine différent pour déterminer simultanément les génotypes et les niveaux de méthylation. Le logiciel peut fonctionner pour des lectures d'extrémité simples et jumelées. BissnP est développé dans le langage de programmation Java. Caractéristiques principales: Appelez et résumez la méthylation de tout contexte de cytosine fourni (CPG, CHH, CHG, GCH ET.AL.); détection de variante précise. Activer la recalibration de la qualité de la base et l'appelant Indel dans le séquençage Bisulfite; Autoriser plusieurs fichiers de sortie, fichiers VCF détaillés, CPG Haplotype lit le fichier pour l'analyse de méthylation mono-allélique; Bedgraph, perruque et format de lit simplifié pour la visualisation dans le navigateur de génome de l'UCSC et le navigateur IGV.

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