Arborescence Analyse de données génétiques facilitée.
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Arborescence Classement & Résumé

Arborescence Mots clés

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Arborescence La description

Les arbres évolutifs sont fréquemment utilisés pour décrire les relations génétiques entre les populations. Les arbres hiérarchiques et bifurquants sont un modèle raisonnable pour l'évolution des séquences et des espèces d'ADN, mais peuvent être appropriés ou non pour décrire la structure de la population dans les populations reliées par le flux de gènes. Par exemple, si les populations sont disposées dans un motif de pas de pierre, les relations génétiques entre les populations ne suivront pas de motif hiérarchique, et des arbres traditionnels de jonction voisine ou d'uppgma peuvent ne pas être des outils appropriés pour décrire la structure de telles populations. TREBERFIT est une application simple développée pour vous aider à analyser la manière dont une arborescence convient aux données génétiques que l'arborescence a été calculée. TreeFit crée des arbres de jonction de voisinage et d'UPGMA à partir d'une matrice de distance génétique, puis compare la distance génétique observée entre les populations avec la distance génétique de l'arbre. La similitude entre ces distances est exprimée comme R-carré, la statistique familière utilisée pour résumer la diffusion des points autour d'une ligne de régression des moindres carrés.

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