Éditeur Analyser les séquences d'ADN avec cet outil.
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Éditeur La description

PriorSeditor est un établissement pratique et facile à utiliser spécialement conçu pour vous aider avec une analyse de la région réglementaire et une découverte de site de liaison de facteur de transcription. Le programme met l'accent sur l'utilisation de prieurs de position pour concentrer la recherche de sites de liaison vers des parties de séquences d'ADN considérées comme plus susceptibles de contenir de véritables sites fonctionnels. Les pistes de priori positionnels peuvent être construites en manipulant, en comparant et en combinant des informations sur diverses fonctionnalités, notamment par exemple la conservation phylogénétique, les sites hypersensibles de la DNASE, les régions répétées, les positions nucléosomes et autres données épigénétiques, les propriétés physiques de l'hélice d'ADN, la distance à partir du site de démarrage de la transcription ou de la distance. la proximité avec d'autres sites de liaison connus et beaucoup d'autres. Les données peuvent être téléchargées à partir du navigateur Génome UCSC (ou importé du fichier) et visualisées avec l'interface utilisateur graphique. Il est également possible d'exécuter de Novo Motif Discovery ou Motif Scanning avec des modèles de motifs connus en interfaçant avec des programmes installés localement. Les résultats peuvent ensuite être visualisés, analysés et post-traités au sein du PriorReditor.

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