Vmtk Programme pouvant être utilisé pour la reconstruction 3D de vaisseaux sanguins
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Vmtk Classement & Résumé

Vmtk Mots clés

produire 3D reconstruire Reconstruction 3D génération de maille vaisseau sanguin

Vmtk La description

Programme qui peut être utilisé pour la reconstruction 3D de vaisseaux sanguins VMTK est composé de bibliothèques et d'outils pour la reconstruction 3D, l'analyse géométrique, la génération de mailles et l'analyse de données de surface dans la modélisation des vaisseaux sanguins à base d'images. Voici quelques caractéristiques essentielles de "VMTK": Segmentation des segments vasculaires (ou d'autres structures anatomiques) des images médicales: · Segmentation de niveau 3D basé sur la gradient. Une nouvelle modalité de calcul de gradient basée sur les différences finies au vent permet de la segmentation de vaisseaux de petits récipients (jusqu'à 1,2 pixels / diamètre). · Niveau interactif définit l'initialisation basée sur la méthode de marche rapide. Cela inclut une nouvelle méthode de sélection d'un segment vasculaire compris entre deux points ignorant automatiquement les branches latérales, aucun paramètre impliqué. Segmentation d'un tractus vasculaire complexe se déclenche pour sélectionner les points d'extrémité d'une branche, laissant niveau de niveau d'étiré par des pics de dégradé avec le terme d'advection unique activé, répétant l'opération pour toutes les branches et la fusion de tout dans un seul modèle. Traitement géométrique d'analyse et de données de surface de modèles 3D de vaisseaux sanguins (et d'objets tubulaires en général) ((les algorithmes clés ont été publiés sur des revues d'imagerie médicale. Vous pouvez trouver une référence complète aux publications des pagesPages de David Steinman et de Luca Antiga)): · Compute les lignes centrales et le rayon de sphère inscrit maximal de structures tubulaires ramifiantes compte tenu de leur représentation de surface polygonale · Split des modèles de surface dans leurs branches constitutives basées sur la géométrie de la ligne centrale · Calculez des quantités géométriques basées sur la ligne centrale (telles que les angles de bifurcation, la planarité, la symétrie, la courbure de la branche, la tortuosité) et les quantités géométriques à base de surface (telles que la distance des lignes centriques, la courbure de surface, la déviation de la tangence des sphères inscrits maximales) · Carte robuste des branches vers un espace paramétrique rectangulaire · Générez des correctifs rectangulaires basés sur la cartographie paramétrique pour une analyse statistique des données géométriques et CFD sur les populations. Scripts, outils d'E / S et algorithmes simples pour fonctionner facilement avec des images et des mailles: · Lire et écrire un certain nombre de formats d'image, de surface et de volume. Inclut un lecteur de série DICOM avec des capacités de retournement automatique, le lecteur de format Netgen Mesh, l'écrivain du format de maille de Netgen XDA, Wrapper de générateur de maille Tetgen, le lecteur de format FDNT Fidap FDNeut Mesh et un générateur de fichiers d'entrée Newtetra · Afficher des images et des mailles · Incapsulez plusieurs classes VTK et mettez-les disponibles sous forme de scripts optimaux. Cubes de marche, lissage de surface, coupure, calcul normal, (connectivité, subdivision, distance entre les surfaces, l'enregistrement ICP) · Ajoutez des extensions cylindriques aux limites de modèle de surface comme étape de prétraitement pour les simulations de la CFD. · Générer des couches de limites d'éléments prismatiques à une épaisseur variable pour la CFD Quoi de neuf dans cette version: · Bug fixe dans la génération d'extension de flux · Amélioration de la surface de la surface · Problèmes de compilation de Windows fixes · Problèmes de compilation fixe 64 bits · Enfin (grâce à la grande contribution initiale de Michalis et à l'aide ultérieure de Hugo et JOPPE), l'exportation fluide vers les fichiers MSH fonctionne correctement et préserve les indicateurs de limites correctement. Cela permet également d'utiliser des mailles VMTK avec OpenFoam. · Les écrivains de maille Dolfin et Lifev fixés et améliorés · Ajout d'une interpolation de fonction radiale · Modélisation efficace supplémentaire des tubes des lignes centrales + rayon · Nouvelles méthodes d'amélioration des navires incluses · Algorithme d'analyse de réseau vasculaire rapide (voir ma thèse de doctorat) porté à VMTK · La projection quadratique de mailles linéaires est désormais une vérification complète des jacobiens négatifs · Ajout de la classe MPR incurvée et du script contribuée par Hugo (avec Vmtkimageshiftscale, vmtksurfacetransforminterActive et amélioration de VMTKSURFACETANSFORM et VMTKIMAGERESLICE - Vérifiez-les!) · Centre-ligne fusionnant ajouté · Ajout d'une extraction de profils de bifurcation · Ajout d'un script de tétraédrimination pour des mailles mixtes

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