Snapp Analyse des données SNP et AFLP: analyse complète des coalescentes sans ces arbres de gène pesky.
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Snapp Classement & Résumé

Snapp Mots clés

arbre Espèce

Snapp La description

SnApp est une mise en uvre gratuite et open-source d'une méthode basée sur la MCMC pour déduire des espèces (population) arbres et démographiques à partir de données SNP non liées. Snapp (le package SNP et AFLP pour analyse phylogénétique) est une suite O Tools pour une inférence évolutive des séquences moléculaires. Snapp utilise un format d'entrée complexe et puissant (spécifié dans XML) pour décrire le modèle évolutif. Cela présente des avantages en termes de flexibilité en ce que les développeurs de Snapp n'ont pas à essayer de prédire toutes les analyses que les chercheurs peuvent souhaiter exécuter et fournir explicitement une option pour le faire. Cependant, cette flexibilité signifie qu'il est possible de construire des modèles qui ne fonctionnent pas bien dans le cadre d'inférence de la chaîne de la chaîne de Markov (MCMC) utilisé. Snapp est multiplate-forme et fonctionne sur Mac OS X, Windows et Linux. Les fichiers binaires pour les plates-formes Windows et Linux sont disponibles sur la page d'accueil du projet.Detited Instructions sur la manière d'installer et d'utiliser l'utilitaire SnApp de votre Mac sont disponibles ici.

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