SPDBV UI conçu pour analyser plusieurs protéines en même temps
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UI conçu pour analyser plusieurs protéines en même temps Swiss-PDBViewer (SPDBV), AKA Feweview, est une application qui fournit une interface conviviale permettant d'analyser plusieurs protéines en même temps. Les protéines peuvent être superposées afin de déduire des alignements structurels et de comparer leurs sites actifs ou toute autre pièce pertinente. Les mutations d'acides aminés, les liaisons H, les angles et les distances entre les atomes sont faciles à obtenir grâce à l'interface graphique et de menu intuitive.Moreover, Swiss-PDBViewer est étroitement liée à Swiss-Model, un serveur de modélisation automatisé d'homologie développé dans l'Institut suisse de Bioinformatics (SIB) En collaboration entre GlaxoSmithKline RD et le groupe de bioinformatiques structurels au Biozentrum à Bâle. Travail de ces deux programmes réduit considérablement la quantité de travail nécessaire pour générer des modèles, car il est possible de enfiler une séquence primaire protéine sur un modèle 3D et obtenir un retour d'information immédiat de la manière dont la protéine filetée sera acceptée par la structure de référence avant de soumettre une demande visant à créer des boucles manquantes et de raffiner Sidechain Emballing.Swiss-PDBViewer est également en mesure de lire des cartes de densité d'électrons et offre divers outils à construire dans la densité. De plus, plusieurs outils de modélisation sont inclus et les fichiers de commande pour les packages de minimisation d'énergie populaires peuvent être générés. Quoi de neuf dans cette version: · L'atome de thymine C6 est maintenant correctement chargé. · Correction de la boucle sans fin de sortie POV-ray sur la version PC. · Le crash occasionnel tout en enregistrant des fichiers PDB (tels que 2i37) sur le PC a été corrigé. · Mise à jour de l'adresse du serveur de cartes de densité d'électrons UPPSALA.

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