RSMatch
Télécharger maintenant

RSMatch Classement & Résumé

RSMatch Mots clés

comparer trouver arn Comparez l'ARN trouver arn Comparaison d'ARN

RSMatch La description

Aligner les structures secondaires d'ARN et trouver des motifs d'ARN RSMatch est un package gratuit et facile à utiliser conçu pour fournir une approche légère de comparer les structures d'ARN, ce qui découvre ainsi des éléments de structure fonctionnelle. Par rapport à d'autres outils de comparaison de la structure d'ARN, RSMatch est rapide, nécessitant du temps quadratique déterminé par la taille de deux structures données. RSMatch utilise deux schémas de notation, c'est-à-dire des systèmes indépendants et dépendants de position. Le schéma indépendant de la position implique deux matrices de notation, une pour les régions à une seule brin et l'autre pour les régions à double échouement. Ce schéma de notation est utilisé dans des comparaisons sister et des recherches de base de données. Le schéma dépendant de la position, également appelé profil, marque des positions de structure individuelles et est utilisée par les multiples fonctions de recherche de base de données et de base de données itératives. RSMatch fournit à la fois des options d'alignement globales et locales, même si ce dernier est plus utile dans la plupart des cas. De plus, RSMatch peut prendre des structures à base de motifs comme entrée.NOTE: Des exemples SOEM sont disponibles ici. Exigences: · Java

RSMatch Logiciels associés