Pyrx

Afficher les données moléculaires avec cet outil
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Pyrx Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • BSD
  • Prix:
  • FREE
  • Nom de l'éditeur:
  • Sargis Dallakyan
  • Site Internet de l'éditeur:
  • http://mgltools.scripps.edu/Members/sargis
  • Systèmes d'exploitation:
  • Mac OS X
  • Taille du fichier:
  • 118.9 MB

Pyrx Mots clés


Pyrx La description

Afficher les données moléculaires avec cet outil Pyrex est une application de dépistage virtuelle facile à utiliser spécialement conçue pour la découverte de médicaments informatique pouvant être utilisée pour sélectionner des bibliothèques de composés contre des cibles potentielles de médicaments. Pyrex permet aux chimistes médicinaux d'exécuter une sélection de filtrage virtuelle n'importe quelle plate-forme et aide les utilisateurs à chaque étape de ce processus - de la préparation des données à la soumission et à l'analyse des résultats des résultats. Bien qu'il soit vrai qu'il n'y ait pas de bouton magique dans le processus de découverte de médicaments, Pyrx inclut l'assistant d'accueil avec une interface utilisateur facile à utiliser, ce qui en fait un outil précieux pour la conception de médicaments assistée par ordinateur. Pyrx comprend également une fonctionnalité de feuille de calcul chimique et un moteur de visualisation puissant essentiel pour la conception de médicaments rationnels. Quoi de neuf dans cette version: · Ajouté Enregistrer sous forme d'outil Valeurs séparées par des virgules (CSV) pour les tables de base de données. · Fonction de traçage ajoutée pour les tables de base de données. Cette fonctionnalité est accessible via un bouton de la barre d'outils dans l'onglet Tables. Par défaut, il ouvre une boîte de dialogue de tractage de table dans laquelle un tracé de barre d'énergie de liaison versus ligand (index) est affiché. Si vous avez du pubchem BioAssay ouvert à l'aide de la touche Open CVS, ce widget vérifiera également s'il ya une colonne de résultat dans cette table et, dans l'affirmative, les barres de couleur correspondent à un composé "actif" rouge et barres correspondant à "inactif" bleu . · Changement de champ de force par défaut pour la minimisation d'énergie ouverte de Babel à partir de UFF à MMFF94. · Modification de valeur par défaut pour un nombre maximal d'évaluations d'énergie (paramètre d'algorithme générique dans AutoDock) à partir de support (GA_NUM_EVALS = 2500000) à court (GA_NUM_EVALS = 250000). · Dialogue Ajout de la soumission d'emploi Autodock PBS. · Correction d'un bug qui causait des problèmes lors de l'affichage des surfaces moléculaires pour les conformations amarrées. · Ajout d'une boîte de dialogue pour sélectionner une alternance de conformation lors de la fabrication de fichiers Macromolecule (PDBQT) pour AutoDock. · L'agent de qualité d'entêtement activé pouvant être utilisé pour obtenir un rapport de bogue et des commentaires d'un utilisateur. · Ajout d'une option d'annulation pour les services Web autogrid. · Résidus flexibles mis en uvre pour AutoDock. Cette fonctionnalité peut être accessible en sélectionnant les résidus sous (s) sous Navigator-> Molécules et en cliquant avec le bouton droit de la souris sur elles. Sélectionnez AutoDock -> Résidus flexibles pour créer un dossier _flex sous Navigator -> AutoDock -> Macromolécules avec récepteur PDBQT et Flex.PDBQT. Tous les amateurs de ce récepteur sont ensuite effectués avec ce (s) résidu (s) flexible (s). · Python mis à jour vers la version 2.6 et ets à 3.4.0.


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