PAÏEN

Un outil qui fournit un procédé d'alignement de séquences multiples à l'aide de graphiques de commande partielle
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PAÏEN Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • GPL
  • Nom de l'éditeur:
  • ari.loytynoja
  • Site Internet de l'éditeur:
  • http://code.google.com/u/116870160609494076183/
  • Systèmes d'exploitation:
  • Mac OS X 10.7 or later
  • Taille du fichier:
  • 3.7 MB

PAÏEN Mots clés


PAÏEN La description

Pagan est une méthode générale pour l'alignement des graphiques de séquence. Le principal avantage de la représentation graphique des séquences est la capacité des graphiques à décrire l'incertitude en présence de caractères à certaines positions de séquence. Ceci est très utile dans l'alignement progressif phylogénétique et permet de capturer les différentes propriétés des insertions et des suppressions lorsque des alignements sont itérés pour plusieurs séquences. De plus, les graphiques permettent de décrire l'incertitude dans les séquences d'entrée et la modélisation par exemple. Les erreurs d'homoploymer dans Roche 454 se lit ou représentent des séquences ancestrales inférées sur lesquelles d'autres séquences peuvent ensuite être alignées. Des instructions détaillées sur la manière d'installer et d'utiliser l'utilitaire Pagan sur votre Mac sont disponibles ici.


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