Loos Bibliothèque d'analyse de structure orientée objet légère
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Bibliothèque d'analyse de structure orientée objet légère LOOS a pour objectif de fournir une bibliothèque de C ++ gratuitement et open source pour l'analyse des simulations de dynamique moléculaire. Cela inclut l'analyse d'un certain nombre de variantes de format PDB, ainsi que la description du système natif et les formats de trajectoire pour charmm, NAMD et AMBER.LOOS ne sont pas destinés à être une bibliothèque entièrement englobante et sont principalement orientées vers la lecture des données et le traitement des données. Cela plutôt que de rédiger plusieurs formats. Quelque-là un certain nombre d'outils utiles sont également inclus dans les loos, l'objectif de LOOS est de faire face aux outils que vous écrivez, non de la fonctionnalité des exigences de Charmm, PTRAJ ou Gromacs: · Xcode · Scons · Boost Quoi de neuf dans cette version: · Ceci est une version de maintenance. Il aborde un bogue dans l'outil d'alignement lors de la création de la trajectoire de sortie et d'utiliser différentes sélections pour aligner sur la transformation par rapport à la transformation. Le bogue provoque une incorrection de la transformation, en fonction de la manière dont les différents centroïdes des deux sélections sont différents. Un bogue mineur dans les arguments de la ligne de commande de l'outil SVD (deux options courtes présentaient le même nom) a été corrigée ainsi qu'un bogue potentiel de la manière dont les histogrammes sont construits pour les outils RDF (provoquant un débordement / débordement).

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