Ligandscout Application logicielle pour la modélisation de pharmacophore avancée
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Ligandscout Classement & Résumé

Ligandscout Mots clés

recouvrir molécule complexe de molécules génération de pharmacophore superposition de pharmacophore pharmacophore

Ligandscout La description

Application logicielle pour la modélisation avancée Pharmacophore LigandScout est un outil logiciel qui permet de rapidement et de façon transparente tirer 3D pharmacophores à partir des données structurelles de macromolécule / ligand complexes dans un des algorithmes demaines entièrement automatisés et pratiques sont scientifiquement publiés et basé sur plusieurs années d'expérience dans la création de pharmacophore , tandis que la demande correspond à l'état de la technique de l'information. Prise en charge de divers formats de pharmacophore communs tels que l'exportation vers CatalystTM, MoetM ou PhaseTM garantissent une interopérabilité maximale des plates-formes de filtrage. L'interface graphique 3D complet utilisateur avec plusieurs niveaux de undo-fera l'exploration du site actif et la création d'pharmacophore au sein du complexe transparent et efficace. L'analyse de site de liaison, l'alignement basé sur la pharmacophore et la création de produits pharmacophores partagés sont conçus pour faire de la ligandscout un outil essentiel pour la conception de médicaments à structure en combinaison avec le dépistage virtuel. LigandScout fonctionne sur tous communs systems.Here d'exploitation sont quelques caractéristiques principales de « LigandScout » :? Interprétation automatique de l'APB ligands en utilisant la géométrie, des dictionnaires et des règles? L'état de l'art de l'interface utilisateur avec graphiques 3D avancées et undo-fonction? vue 2D et vue hiérarchique directement liés à l'interface 3D? Alignement rapide des molécules dans leur conformation bioactive à d'autres molécules et pharmacophores 3D de plusieurs ligands et / ou pharmacophores, pharmacophores caractéristique commune peut être dérivée pour comprendre et modéliser le mode d'action pertinent? manipulation avancée des co-facteurs, des ions, des molécules d'eau et des ligands liés par covalence? Pharmacophore exportation vers Catalyst (tm), MOE (tm) et la phase (tm) pour le criblage virtuel? le contrôle des paramètres étendu pour les utilisateurs plus expérimentés? Avancée perception ligand PDB et la correction manuelle facile lors de la modélisation dans le site actif? Capacité à traiter les co-facteurs et des molécules d'eau dans le cadre du ligand ou une partie de la macromolécule? Intuitive alignement sur la base de molécules-pharmacophore? Support pour la plupart des formats de fichiers courants? fichier sophistiqué et la gestion du référentiel des sites de liaison édités et stockés, des molécules et pharmacophoresRequirements :? au moins 512 Mo de RAM (1 Go recommandé)? Java 1.5 environnement d'exécution? Accélération matérielle carte graphique 3D (NVIDIA ou ATI recommandé) avec OpenGL 1.2 Limitations support: · 30 jours d'essai

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