Koriblaste fournit plusieurs interfaces utilisateur graphiques et des outils d'analyse pour afficher facilement et pour explorer les résultats d'exploration.
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Koriblaste Classement & Résumé

Koriblaste Mots clés

DÉTRUIRE requête résultat analyser les données Bouchon résultat de la requête

Koriblaste La description

Fournit plusieurs interfaces utilisateur graphiques et outils d'analyse pour voir facilement et à explorer les résultats BLAST. KoriBlast est un environnement graphique fiable dédié à l'extraction de données de séquence. KoriBlast combine recherches BLAST avec des capacités de gestion des données avancées et un état de l'art interface utilisateur graphique. KoriBlast propose un programmateur BLAST graphique capable de comparer en même temps de multiples séquences d'interrogation des bases de données de séquences multiples en utilisant un réseau ou d'un moteur local BLAST. KoriBlast fournit plusieurs interfaces utilisateur graphiques et outils d'analyse pour visualiser facilement et d'explorer les résultats de BLAST, de manière significative, ce qui facilite l'interprétation des données. De plus, KoriBlast est capable de récupérer automatiquement les données à partir de bases de données NCBI ENTREZ, intégrant des informations précieuses directement dans les rapports BLAST graphiques. Enfin, toutes les informations disponibles à partir KoriBlast peut interroger ce qui vous permet de localiser rapidement les informations pertinentes tout en réduisant la quantité de données à analyse.Note: Pour télécharger et recevoir une clé de licence qui vous permettra d'exécuter l'application que vous devez vous inscrire. Voici quelques caractéristiques principales de « KoriBlast »: · Un convivial et facile à apprendre le logiciel graphique. · Un planificateur BLAST pour effectuer une recherche avec plusieurs séquences de requête sur plusieurs bases de données en même temps. · Requêtes BLAST sont exécutées à l'aide du serveur NCBI BLAST ou une installation locale de BLAST. · Astucieusement intégrée des outils d'analyse graphique fournissant un système d'exploitation BLAST très efficace. · Importer des données supplémentaires (hits connus caractéristiques) par un accès direct et transparent aux sources de données biologiques. · Les données importées sont: intégrées dans les résultats BLAST, affichés dans les rapports graphiques, disponibles pour filtrer les résultats BLAST. · Repérer l'information pertinente en utilisant des filtres. · Réduire la quantité de données à analyser en utilisant des filtres. · Les données stockées sur le disque de l'utilisateur restent disponibles au fil du temps. · Exporter des données vers des applications de feuille de calcul. · Récupérer des séquences de succès complètes de bases de données de séquence à distance. · Exporter des séquences de vie complet des fichiers FASTA. · Re-BLAST précédentes requêtes BLAST avec un simple clic de souris. · Re-BLAST complet séquences de succès avec un seul clic de souris. · Affichage plein écran des entrées de succès en utilisant votre navigateur Web favori. Exigences: · PowerPC (G3 ou plus récent) ou d'un processeur Intel Pentium. · Une machine virtuelle Java (JVM) 1.5.0 ou au-dessus. · Au moins 128 Mo de RAM (256 Mo recommandé). · Une résolution d'écran de 1024 par 728 pixels. Limites: · Période d'essai de 14 jours. Quoi de neuf dans cette version: · Recherches PSI-Blast sont disponibles à partir du module de recherche et le module Analyser a été adapté pour permettre une analyse étendue des résultats (voir figure ci-dessous, et voir cette vidéo). · Préparer Blast personnel des banques de données de GenBank natif, Genpept, EMBL, SwissProt et fichiers UniProt, en utilisant le texte soit simple ou gzip fichiers compressés (voir cette vidéo). · Installez pré-formaté NCBI souffle directement à partir de leurs bases de données des fichiers « tar.gz » natifs (voir cette vidéo). · Les filtres de recherche de conception permettant la recherche de motifs sur des séquences de vie. · Comparer les résultats de recherche pour trouver de nouveaux, commune ou supprimé hits. · Les fichiers de données d'exportation KoriBlast et les filtres à partager avec des collègues ayant KoriBlast ou BlastViewer. · Nouvelle séquence Viewer pour afficher et manipuler des séquences (extrait, traduire, obtenir des compositions) téléchargé à partir des référentiels publics (voir figure ci-dessous). · Meilleure gestion des grands projets impliquant des milliers de séquences.

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