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Application conviviale pour effectuer une analyse de la génétique de la population GENODIVE est une application conviviale pour effectuer une analyse de la génétique de la population. Il comporte une interface utilisateur intuitive et sans encombrement, derrière laquelle se trouvent des outils statistiques puissants. Génodique peut gérer des données génétiques ainsi que des matrices de distance et des données écologiques, vous permettant de combiner des données de plusieurs sources différentes en une seule analyse. Génodique présente plusieurs analyses qui ne sont pas disponibles dans d'autres programmes tels que la cluster de K-EXIME à base d'AMOVA, des tests de reproduction clonale et d'AMOVA pour les données polyploïdes et des coefficients normalisés de la différenciation de la population. Et le meilleur de tous les travaux génodatifs sur un Mac! Voici quelques caractéristiques essentielles de «génodives»: · Nombreux types de dédicaces: Génodique présente de nombreux types de déductions statistiques, dont certains ne sont pas disponibles dans aucun autre logiciel de génétique de la population. Les inférences incluses figurent entre autres: une analyse flexible de la variance moléculaire, l'estimation des coefficients moléculaires de la différenciation de la population, la regroupement de K-moyen de la population utilisant une approche de recuit simulée, attribuant une identité génotypique (clones) aux individus, des tests de reproduction clonale, des tests de hardyse Equilibre Weinberg, calcul de l'indice hybride pour les individus et différents types de tests de manteau. · Analyser plusieurs jeux de données ... simultanément! Tous les Mac vendus de nos jours contiennent plusieurs curs de processeur. Cependant, la plupart des programmes ne peuvent utiliser qu'une partie de la puissance de ces nouveaux ordinateurs, car ils n'utilisent qu'un seul processeur à la fois. Génodique détecte automatiquement le nombre de processeurs présents dans l'ordinateur et divise les tâches longues sur eux tous. Les calculs ont toujours lieu à l'arrière-plan afin que vous puissiez effectuer d'autres analyses en attendant les résultats d'une analyse plus longue. · Formats de données multiples: Génodique peut gérer trois types de données différents: MarkerData (par exemple à partir de microsatellites), des matrices de distance (par exemple, des distances génétiques par paires par paires entre populations) et d'autres données génériques (par exemple, les coordonnées des populations), qui peuvent être combinées dans la Inférences statistiques. Importation de données dans GENODIVE est simple: il suffit d'ouvrir un fichier et une génodive déterminera automatiquement le type de données qu'il est et chargera les données en mémoire. Génodique détectera même si MarkerData est dans GenePop, Fstat, GenePop, Spagedi, Genetix, Bayesass, Structure ou Migrate Format. · Inclure facilement et exclure les observations: la plupart des ensembles de données réels sont loin d'être parfaits, certains loci peuvent être plus difficiles à marquer que d'autres et il y aura toujours des individus dont l'extraction de l'ADN a donné un ADN de faible qualité. Dans la plupart des programmes, cela signifie quitter le programme, modifiant l'entrée de l'entrée, puis redémarrer le programme avec le nouveau fichier. Génodique facilite l'inclusion ou exclure les LOCI, les individus, les clones, les niveaux de ploïdy, les populations ou même des groupes de populations entiers, l'effet de ces valeurs aberrantes sur le résultat des analyses peut être évaluée. · Une vue dégagée sur vos données: Génodive dispose d'une interface claire et dégagée, qui vous permet de conserver une vue d'ensemble de vos données et d'analyses. Vous pouvez choisir entre la visualisation de vos données en tant que texte brut ou la visualisation en tant que matrice. Le panneau d'inspecteur indique les informations les plus importantes pour les données actuelles: combien d'individus sont inclus par population, le nombre de groupes de populations, que les locus sont inclus, le nombre d'allèles par locus et un journal avec les analyses qui ont été effectuées sur cette base de données. · Options de recherche approfondies: avec génodive, vous pouvez rechercher vos données de différentes manières: par Allele, par nom individuel, par population, par clone ou par toutes ces catégories en même temps. La recherche peut être très spécifique: vous pouvez par exemple rechercher tous les noms de population qui commencent par la chaîne "nl" ou tous les allèles de plus de 150 bp.note: il s'agit d'une version préliminaire publique que NMEANS contient toujours des bugs, Et certaines analyses ne sont pas encore complètement mises en uvre. Si vous utilisez cette version bêta, vous êtes lié par l'honneur de signaler des problèmes, des bogues ou des éloges que vous pourriez avoir à l'auteur. Quoi de neuf dans cette version: · Amélioration de la compatibilité avec Mac OS 10.6 "Snow Leopard". · Disponible la possibilité d'afficher l'écran des éclaboussures au démarrage, car cela pourrait entraîner des crashs. · Correction du bogue en lecture du format GenePop. · Restructuration interne des procédures d'affectation.

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