Cristalexplorer CRYSTALEXPLORER - Outil de visualisation du cristal moléculaire entièrement présent
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CrystalExplorer - outil de visualisation de cristal moléculaire entièrement en vedette CrystalExplorer est un outil de visualisation cristal moléculaire entièrement en vedette, disponible pour Mac OS X, Windows et Linux. CrystalExplorer fournira une nouvelle façon de visualiser les cristaux moléculaires en utilisant la gamme complète de la surface Hirshfeld tools.NOTE: Gratuit pour les fonctions use.Main académiques, non commerciales de CrystalExplorer: Hirshfeld surfaceThe surface Hirshfeld est une definiton unique d'une molécule dans un cristal. La surface est définie par la partie de l'espace où les contribue de densité d'électrons de promolecule plus de la moitié de la procrystal totale électrons density.CrystalExplorer génère et affiche Hirshfeld surfaces de la façon dont ils ont été conçus, et permet de tracer des propriétés sur la surface Hirshfeld, y compris de , dnorm, indice de forme et de couleurs curvedness.Each sur la surface Hirshfeld met en évidence les différents aspects de l'emballage de cristal qui aurait pu être difficile à découvrir par parcelle d'empreintes digitales traditionnelle means.Fingerprint plotsThe de la surface Hirshfeld est un en deux dimensions, couleur représentation de toutes les interactions intermoléculaires dans un cristal structure graphique d'empreinte digitale est un moyen unique de comprendre rapidement la nature des interactions intermoléculaires dans un cristal, et est facilement reproduite sur l'écran ou les surfaces paper.Decomposed et fingerprintsNew à CrystalExplorer 2 est la capacité à se décomposer et la surface courbe empreinte digitale particulière de se concentrer sur types d'interactions intermoléculaires, comme indiqué dans notre récent chimique Communication.See quelles parties de la molécule sont impliqués dans un type particulier d'interaction intermoléculaires en mettant en évidence que les contacts sur la surface. Comparer les interactions intermoléculaires entre les structures en examinant l'empreinte digitale pour que ce type de interaction.Perform comparaisons quantitatives entre les structures en fonction de la contribution de la surface d'une donnée interaction.In 3-aminophénol (à droite), l'empreinte digitale décomposée montre clairement la contribution à la Structure de N ··· H, O ··· ··· H, C H et H ··· H contacts intermoléculaires. Cette version décomposées de l'empreinte digitale est utile pour comparer un seul type d'interaction entre structures.POV-Ray exportProduce graphiques sur papier glacé, lickable connexes pour une couverture de journal, ou pour votre affiche, en exportant des graphiques à partir CrystalExplorer comme fichier d'entrée POV-Ray . Téléchargez et installez POV-Ray sur votre ordinateur pour générer des graphiques haute résolution en un seul clic de CrystalExplorer.TontoThe programme open-source Tonto lecteurs de calculs de CrystalExplorer. En raison de cela, vous avez accès à un programme de mécanique quantique entièrement en vedette avec la possibilité de propriétés calculate telles que les potentiels électrostatiques et ab initio densités électroniques moléculaires. Vous pouvez même carte une de ces propriétés sur la surface Hirshfeld! Quoi de neuf dans cette version: Soutien gaussienne: Cette version ajoute le support pour le calcul moléculaire à l'aide de fonctions d'onde 98/03 gaussienne lorsqu'il est installé. Note: Malheureusement, nous n'étions pas en mesure de faire ce travail de fonctionnalité sur Windows. Fenêtre des préférences: Nous avons déplacé tous les paramètres et préférences en un seul volet Préférences, disponible dans le menu Fichier (ou le menu CrystalExplorer sous Mac OS X). Lorsque cela est possible, les changements prennent effet immédiatement, donc il n'y a pas OK ou sur le bouton Appliquer. Menus réarrangé: Nous avons réorganisé les menus pour les rendre plus cohérents, et nous avons supprimé certains éléments de menu qui ne fonctionnait pas (comme l'élément de menu Set de charge). Vues enregistrées: Vous pouvez maintenant enregistrer l'orientation et à l'échelle de votre point de vue (Voir Enregistrer cette vue!), Puis revenir plus tard à ce point de vue (Voir Get Saved View!). Ceci est particulièrement utile lorsque vous enregistrez graphiques et il est important qu'ils sont sur la même échelle. Vous pouvez enregistrer une vue par cristal. Améliorations des parcelles d'empreintes digitales: parcelles d'empreintes digitales sont maintenant générés automatiquement lorsque la surface est générée, et la fenêtre d'empreintes digitales met automatiquement à jour pour afficher le graphique correct lorsque vous faites un clic droit sur une surface. l'exportation d'empreintes digitales est EPS maintenant, plutôt que PostScript ordinaire, pour l'incorporation dans des documents plus facile. Nouveau système de licence: cela devrait être transparent pour vous (puisque vous avez déjà une licence), mais nous avons déjà réécrit le système de génération de code de licence, afin d'éviter un bogue récurrent où les personnes avec certaines combinaisons de lettres de leur nom utilisaient des licences invalides. Ce problème devient de plus en plus courant au fil du temps (puisqu'il y avait une composante de date du code de la licence). Meilleure manipulation du désordre: tandis que le désordre est toujours un problème grave pour l'analyse à l'aide de surfaces Hirshfeld (voir ici), nous faisons au moins un meilleur travail de dessin des structures désordonnées à l'écran. Les atomes de groupes de troubles différents ne sont plus dessinés comme liés; Lorsqu'une structure (ou une partie d'une structure) est désordonnée sur deux sites ou plus, appuyez sur Ctrl-D pour basculer d'affichage différent des atomes désordonnés en fonction du réglage du volet de préférences de contact et du désordre. Beaucoup de corrections de bugs.

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