Arcadia une application de bureau léger conçue pour visualiser des réseaux biologiques tels que des voies métaboliques
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Arcadia Mots clés

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Une application de bureau légère conçue pour visualiser des réseaux biologiques tels que des voies métaboliques Arcadia est un spectateur, pas un éditeur: cela signifie une interface plus simple, offrant de multiples perspectives sur les mêmes données, en mettant l'accent sur la navigation.An un composant alternatif léger, autonome, est facile à déployer et à entretenir. Afin de garantir l'interopérabilité avec d'autres outils, il est fait que des efforts sont déployés pour soutenir les normes existantes ou émergentes telles que SBML et SBGN.A Cadre de référence pour le développement de l'Arcadia est utopie: une source ouverte et une série interopérable d'outils de bureau pour l'analyse des protéines, Construit selon le modèle de modèle / vue / contrôleur. Cette approche, ainsi que la programmation orientée objet, constitue un logiciel flexible et évolutif.Arcadia est multiplate-forme et est développé principalement en C ++. Arcadia utilise de puissantes bibliothèques open source existantes: · libsbml => une interface pour les fichiers de la voie SBML · La bibliothèque de graphes de boost => Une structure graphique efficace · GRAPHVIZ => Algorithmes de présentation classique · Libavoid => Routage de bord dynamique · QT => L'interface utilisateur graphique Voici quelques caractéristiques clés de "Arcadia": · Listes de réactions triées et espèces biochimiques · Propriétés détaillées des éléments sélectionnés · Représentations graphiques de l'ensemble du réseau · Cartes locales? Pour les groupes de molécules voisines Exigences: · C ++

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