Aligneur de codoncode Une excellente application d'assemblage de séquence, d'édition de contig et de détection de mutation
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Aligneur de codoncode Classement & Résumé

Aligneur de codoncode Mots clés

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Aligneur de codoncode La description

Une excellente application d'assemblage de séquence, d'édition de contig et de détection de mutation L'aligneur de codoncode est un programme d'assemblage de séquence, d'édition de contig et de détection de mutation, disponible pour Windows et Mac OS X. Aligner est compatible avec Phred-Phrap et prend en charge des scores de qualité de séquence entièrement en prenant en charge une interface utilisateur familière et facile à apprendre. .Codoncode Aligner vous permet de profiter pleinement des algorithmes modernes pour l'assemblage des appels de base et de la séquence, sans vous obliger à apprendre des options de ligne de commande compliquées ou de la programmation PERL. Voici quelques caractéristiques essentielles de "Codoncode Aligner": · Importez des séquences à partir de fichiers texte. · Importez des séquences de fichiers ABI et SCF. · Clip de fin. · Garniture de vecteur. · Assemblez de contigs. · Aligner sur une séquence de référence. · Alignez les conttigmes les uns aux autres tout en conservant les liens vers les traces. · Assemblez ou alignez dans les groupes, en fonction des noms d'échantillons. · Trouver des mutations hétérozygotes. · Analyser les insertions hétérozygotes et les suppressions. · Définir les régions d'intérêt («fonctionnalités»), par exemple des régions de consensus de haute qualité. · Naviguez rapidement entre des fonctionnalités définies par l'utilisateur. · Importer et modifier des assemblages générés par expression. · Exécutez PHRED et Phrap directement à partir de projets d'alignement. · Vous avez également la possibilité d'exporter des fonctionnalités et des séquences. · Exporter des projets d'assemblage compatibles avec consentement. Limites: · Période d'essai de 30 jours. · Vous pouvez utiliser dans vos projets uniquement des échantillons non assemblés. · De plus, vous ne pouvez pas enregistrer, exporter ou imprimer des projets contenant des contigus, ou après avoir essayé l'une des fonctions restreintes (Aligner vous avertira en premier). Quoi de neuf dans cette version: · Traduction d'acides aminés pour tous les échantillons. · Couleurs d'arrière-plan basés sur la traduction de protéines. · Tables de différence. · Importer directement à partir de Genbank. · Menu de script. · Nouvelles commandes de script. · Importer 454 données (fichiers SFF). · Créer de nouvelles séquences de texte. · Soutenir des projets plus importants. · Assemblages plus rapides. · Utilisation automatique de la mémoire sur Windows. · Soutien amélioré de la tablette du stylo.

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