Abacas Congréguation automatique basée sur algorithmique des séquences de fusil de chasse assemblées assemblées
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Abacas Classement & Résumé

Abacas Mots clés

visualiser aligner apprêt contigutant apprêt alignemnt Visualize primer contigugner

Abacas La description

Contimise automatique basée sur algorithmique des séquences de fusil de chasse assemblées Abacas vise à contempler rapidement (alignement, commande, orientation), concevoir et visualisez les amorces pour fermer les lacunes sur des contigus assemblés de fusil de chasse basé sur une séquence de référence.Abacas utilise Mummer pour trouver les positions d'alignement et identifier des syntenies de contiguations assemblées contre la référence. La production est ensuite traitée pour générer une pseudomolécule de saisir des contigs et des lacunes qui se chevauchent. ABACAS génère un fichier de comparaison qui peut être utilisé pour visualiser des contigranes ordonnées et orientées dans ARTEMIS ACT. La synténie est représentée par des barres rouges où l'intensité des couleurs diminue avec des valeurs inférieures de pourcentage d'identité entre des blocs comparables. Les informations sur les contiguations telles que l'orientation, l'identité en pourcentage, la couverture et le chevauchement avec d'autres contigus peuvent également être visualisées en chargement du fichier de fonctionnalités sorties sur Act. Exigences: · Mummer · Acte d'Artemis (facultatif) Quoi de neuf dans cette version: · C'est la dernière version d'Abacas.

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