Weatwatersegmenter Un programme de python graphique pour segmenter de manière interactive les piles d'images de cellules dans les tissus avec des étiquettes de bord
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Weatwatersegmenter Classement & Résumé

Weatwatersegmenter Mots clés

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Weatwatersegmenter La description

Wreatwatersetergmenter est un outil python graphique pour segmenter de manière interactive les piles d'images de cellules dans des tissus avec des étiquettes de bord (aka. Des contours blancs). Les interactions sont entièrement basées sur l'édition de graines, qui sont à leur tour développées par un algorithme de bassin versant. La principale différence entre SWS et d'autres outils est que vous pouvez placer plus d'une graine par cellule qui peut vous aider à ajuster les limites des cellules difficiles.SSS est construite sur le dessus de WXPython, Matplotlib, Numpy, Sciped et Mahotas.at son noyau , il utilise un algorithme de bassin hydrographique rapide (grâce au projet Mahotas) et permet des mises à jour en temps réel. Il a une simple interface utilisateur (si encombré) et est entièrement interactive, incluant même 1 niveau d'annulation.La publication sur les SWS qui donne tous ces détails et plus en cytométrie partie A: http: //onlinelibrary.wiley.com/di/10.1002 /cyto.a.22034/AbRactSource Code est reflété à quatre référentiels et à PYPI: - GitHub: http://github.com/davidmashburn/seedwatersegmenter/- Bitbucket: http://bitbucket.org/davidmashburn/seedwaterseGmenter- Gitorieux: http://gitorieux.org/seedwatersegmenter- Code Google: http://code.google.com/p/seedwater/- PYPI: http://pypi.python.org/pypi/sedwatersegmenterLe page de codes Google a également du binaire Communiqués (http://code.google.com/p/seedwater/) qui devrait fonctionner sur Windows 32 bits ou 64 bits Linux, mais ceux-ci sont maintenant anciens. Veuillez utiliser la méthode "easy_install" maintenant.Pour plus de détails, voir Python Instructions d'installation 20xx.txt Vous pouvez également vouloir lire le manuel: Segmentation de l'eau de sévère V xx Manual.txtinstalling et runninginstalling est enfin facile! En fait, vous pouvez maintenant "easy_install WEWWATERSEGENTEREGENTER "Instructions rapides: Windows / Mac: Guide de l'installation Distribution Python http://www.enthth.com/products/dedownload.phpubuntu/debian: Sudo apt-get d'installation Python-SeugoTools Python-Wxtools Python-Numpy Python-Scipy Python - Matplotlib Python-Imaging Python-XLRD Python-XLRD Python-XLRD Python-XLWTIN Une fenêtre CMD (doit être exécutée en tant qu'administrateur sous Windows Vista / 7) ou Terminal (Mac / Linux), Exécuter: easy_install Mahotas CMPGen ellipsefitter FileNamesAssafficader ImageContour SeedwatersEgmentEntère: la dernière version est appelée: "Python Instructions d'installation août 2012.txt" https://github.com/davidmashburn/seedwatersegmenter/blob/master/python Instructions d'installation Août 2012.TxtProduct Page d'accueil

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