 | Planificateur de RFLPRFLP Planner est un outil qui aide à planifier une expérience de RFLP. |
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Planificateur de RFLP Classement & Résumé
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Planificateur de RFLP Mots clés
Planificateur de RFLP La description
RFLP Planner est un outil qui aide à planifier une expérience de RFLP. RFLP Planner est un outil qui aide à planifier une expérience de RFLP: il trouve des enzymes de restriction qui coupent un ensemble de séquences d'ADN d'homologue de différentes manières et simule l'image de gel-électrophorèse résultante. Le programme vous aide à trouver les enzymes de restriction cruciale qui caractérisent la population. Avec la simulation d'électrophorèse, il est facile de choisir les enzymes de restriction qui montrent le meilleur polymorphisme sur le gel.Une le mot clé important est la biodiversité. Certaines fonctionnalités clés du "Planificateur RFLP": · Simulation de gelimages (PNG): chaque séquence une image . Chaque image avec un marqueur de poids moléculaire. Toute enzyme de restriction One Slot. · L'évaluation est effectuée avec toute la base de données d'enzyme de restriction de Bioperl, mais les enzymes souhaitées peuvent également être ajoutées (sites d'enzyménomène ou de restriction) · Les isochimomers ne sont pas utilisés pour des calculs (mais apparaissent dans les fragments résultants.txt) · Les séquences peuvent être coupées à la même longueur ou non, mais pour la gelImage Les séquences d'origine sont utilisées · Les bandes de marqueur de poids moléculaire souhaitée peuvent être étiquetées · Option pour étiqueter des images (avec nom de séquence) · Beaucoup de formats d'entrée et de sortie différents sont pris en charge. (Bioperl) · Abuser le programme pour couper des séquences d'apprêt d'un tas de séquences: 1. dans une séquence couper la séquence d'apprêt manuellement2. Importer toutes les séquences (FASTA) 3. Choisissez: trimm = 1, aligné_format = 'fasta' · Supprimer automatiquement les séquences d'alignement incorrectes · Choisissez la plage d'enzymes de restriction recherchées (4, 6,. -BP Cutter) · Séquences de complément inverse automatiques (ne fonctionne pas pour une grande quantité de SEQ; Si cela ne fonctionne pas, essayez avec moins de séquences, exportez-vous à FASTA, rejoignez toutes les séquences, calculez la totalité des séquences, calculez l'ensemble des exigences: · Perl · BIOPERL · GD-Bibliothèque · Terme :: Ansicolorwhat What's News dans cette version: · Possibilité de choisir un dossier de sortie où tous les fichiers seront stockés · Si les fichiers d'écriture échouent, le message où ils sont stockés · TextFile avec des fragments d'enzymes ont un beau horaire "humanreadable". · Le fichier de fragments d'enzyme est formaté maintenant en utilisant des espaces au lieu des onglets -> Cela facilite la tâche. Lisez dans l'éditeur de texte, mais plus difficile à inporté de tables.
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