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Ghemique est un package de modélisation moléculaire avec des outils d'interface graphique et de visualisation 3D.
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Grogne Classement & Résumé

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  • Rating:
  • Licence:
  • GPL
  • Prix:
  • FREE
  • Nom de l'éditeur:
  • TH
  • Site Internet de l'éditeur:
  • http://www.uku.fi/~thassine/ghemical/

Grogne Mots clés


Grogne La description

Ghemique est un package de modélisation moléculaire avec des outils d'interface graphique et de visualisation 3D. Ghemical est un package de logiciel de chimie calculationnel publié sous la GNU GPL. Cela signifie que le code source complet du package est disponible et les utilisateurs sont libres d'étudier et de modifier le package. Ghemical est écrit en C ++. Le projet ghemique a une interface utilisateur graphique (basée sur GNOME), et il prend en charge les modèles de mécanique quantique (semi-empirical et ab initio) et modèles de mécanique moléculaire (il y a un tripos expérimental de type 5,2 Champ de force pour Molecu organique Aussi un outil de réduction des modèles de protéines est inclus. L'optimisation de la géométrie, la dynamique moléculaire et un ensemble d'outils de visualisation sont actuellement disponibles.Ghemical repose sur le code externe pour fournir les calculs quantiques-mécaniques. Semi-empirique Méthodes MNDO, MINDO / 3, AM1 et PM3 proviennent du paquet MOPAC7 (domaine public) et sont incluses dans la distribution source.Le package MPQC (GNU GPL) est utilisé pour fournir des méthodes AB Initio: les méthodes basées sur Hartree-Fock La théorie est actuellement prise en charge avec des ensembles de base allant de STO-3G à 6-31G **. Le code MPQC n'est pas inclus dans la distribution de la source. Pour utiliser les méthodes AB Initiari basées sur MPQC en Ghemical, vous devez d'abord compiler et installer la Programme MPQC pour votre système, puis compiler Ghemical en utilisant certains paramètres spécifiques qui relient les programmes ensemble; Voir le fichier d'installation pour plus d'informations. Ghemique contient également le package OpenBabel pour importer et exporter de nombreux formats de fichiers différents (ainsi que d'autres tâches) .InstallationOnce Vous avez téléchargé la dernière version, vous devez extraire tous les fichiers de votre fichier d'archive à l'aide de "TAR -ZXVVF GROMICHIQUE-1.00.TGZ "ou de manière équivalente" gunzip ghemical-1.00.tgz; gol -xvvf ghemical-1.00.tar ". Après cela, veuillez lire le «Installer» -file que vous venez de vous extraire pour obtenir des informations supplémentaires. Ce qui est nouveau dans cette version: · Ghemical se dirige maintenant vers une nouvelle version stable. · La version actuelle est la version recommandée de «production». · Ce n'est pas une libération stable officielle en raison du nouvel port Win32, qui nécessite encore des touches de finition avant que tout ne fonctionne.


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