Génomorama: Visualisation du génome Genomorama: la visualisation du génome est un programme de visualisation et d'analyse multi-plateforme multiples, multi-génomes multiples.
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Génomorama: Visualisation du génome Classement & Résumé

Génomorama: Visualisation du génome Mots clés

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Génomorama: Visualisation du génome La description

GENOMORAMA: Visualisation du génome est un programme de visualisation et d'analyse multi-plateforme multi-plateforme multiples. GENOMORAMA: Visualisation du génome est un programme de visualisation et d'analyse multi-plateforme multi-plateforme multiples. Il fournit une interface puissante et facile à utiliser qui exploite la puissance de visualisation des ordinateurs modernes (via OpenGL) et l'infrastructure bioinformatique substantielle fournie par la NCBI (via la boîte à outils NCBI C). Le génomorama est écrit en C ++ portable et hautement optimisé et est livré dans trois "saveurs" qui lui permettent de fonctionner de manière native sur (la plupart) systèmes d'exploitation modernes: OS X (en carbone), Microsoft Windows (à l'aide de MFC) et Linux (à l'aide de Motif). . Les exécutables et le code source sont fournis librement pour toutes les saveurs. Certaines caractéristiques essentielles de "Visualisation du génome de Genomorama": · Les performances élevées n'ont pas été sacrifiées sur l'autel de la portabilité · OpenGL Graphics Profitez des cartes graphiques optimisées de jeu vidéo disponibles dans La plupart des ordinateurs de bureau et des ordinateurs portables. · C ++ permet une utilisation transparente et complète des ressources système (comme mémoire). · Boîtiers à outils de fenêtres (carbone, MFC et motif) pour chaque système d'exploitation facilitent la réactivité et la facilité d'utilisation. · Un autonome, soi -Décutabilité exécutable free Génomorama de dépendance à des applications tierces. · Le code source de toutes les plateformes est disponible librement. · Une interface utilisateur attrayante et complète · Genomorama présente une interface utilisateur propre et épurée. · Le rendu multi-échelle affiche les détails pertinents tout en maintenant lisibilité. · Utilisez un clavier ou une souris pour zoomer efficacement, panne et explorer efficacement des génomes de taille arbitraire. · Beautiful WYSIWYG PostScript et GIF OUT Mettez des formats produisant des images de qualité de publication. · Des fonctionnalités nouvelles pour faciliter l'analyse du génome · En plus des options de recherche standard (comme requête par séquence et nom de gène), Genomorama propose des recherches basées sur l'hybridation de l'ADN "en avant et en arrière". · Fournir une paire d'amorces PCR et le génomorama émettra les amplicons. · Fournir une sonde d'hybridation et un génomorama trouveront des sites de liaison. · Fournir une paire de sondes de cadenas et de génomorama identifiera les emplacements de liaison · fournir un ensemble de critères d'amorce de PCR (longueur, température de fusion, composition de base, etc.) et le génomorama trouvera PCR Les amorces. · Genomorama peut afficher et rechercher un nombre arbitraire de génomes (limité uniquement par la mémoire de l'ordinateur). · Hobinez la puissance de la boîte à outils NCBI pour accéder directement à la base de données NCBI Entrez. · Compute Profil de fusion, en plus de la composition de base traditionnelle. des parcelles (c.-à-d.% G + C,% A + T, etc.) .Quelle est nouvelle dans cette version: · Cette version corrige les bugs suivants: analyse des fichiers GBK qui contiennent des annotations de base unique sur le fil de complément; · Matchs exacts manqués à 3 'fin de la séquence cible; · Analyse fragile de la plage d'annotation; · Téléchargement de très grands enregistrements de Genbank (c'est-à-dire des chromosomes humains); · Et omis de l'espace intergénique après des annotations de base unique (I.E. SNPS). · Les enregistrements de couleurs personnalisés sont maintenant enregistrés pour lire et lire des fichiers GBK. · Un exécutable spécifique à Intel OS X a été ajouté. · La boîte de dialogue Information a été réalisée.

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